這第二步是整治是否能夠成功的關鍵。
所以鄭勛睿的絕大部分精力，都放到這上面了，他的計劃是很深遠的。
漕運並非最為重要的事宜，說起來就是利用京杭大運河貫穿南北的物資交流，這個任務並不是很複雜，無非是掌管此事的官吏，以及民間的某些協調組織，產生了邪念。加之這裡面有東林黨人插手了，讓漕運變得異常的複雜，也變得黑幕重重，一旦斬斷了其中的利益鏈條，漕運就能夠變得簡單了。
鄭勛睿的主要精力，還是在鄭家軍的建設方面。
此次端掉了十大漕幫，順帶也清除了一些名不見經傳的小漕幫，鄭家軍繳獲了三千萬兩白銀。這些銀子可以做大事情了，同時鄭勛睿和鄭家軍都來到了南方。淮安靠近南京，鄭勛睿計劃的壯大鄭家軍實力、潛心研發火器的計劃，可以開始考慮和實施了。
讓鄭家軍成為一支無堅不摧的軍隊，這才是鄭勛睿最為要緊的事情。
相關的奏摺早就送到京城去了，不過皇上的聖旨和吏部的敕書遲遲沒有下來，鄭勛睿也不好催促。這期間他接到了楊廷樞的來信，楊廷樞仔細說了京城裡面的波動，說到朝野對淮安發生的事情，還是有著很多議論的，但是皇上沒有專門提及此事。早朝也沒有議論這件事情，幾個押解到京城的知府，關在大理寺的監牢裡面，暫時也沒有人理睬。
京城裡面如此平靜的局面，應該是在鄭勛睿的預料之中的，他早就做過前期的準備事宜，寫了好幾封信，穩住了某些人的情緒，要不然出現這麼大的事情，京城裡面豈不是炸鍋了。
聖旨和敕書遲遲不下來，鄭勛睿想到了東林黨人。
淮安的動作，應該是威脅到東林黨人的根基了，且不說京城，就說南方，東林黨人引以為豪的黃道周都親自出面了，可見東林黨人是察覺到了危險的，只不過沒有地方著手。
當然鄭勛睿有著絕對的信心，這一次的動作，迅雷不及掩耳，東林黨人不可能做出很好的準備，也想不到其他的辦法來應對，不僅僅是這樣，一旦做好了第一步和第二步的所有事宜，接下來鄭勛睿就要開始對準南方的那些士大夫和商賈了。
所以鄭勛睿不著急，耐心等待皇上的聖旨或者是吏部的敕書。
十一月初一，吏部的敕書終於到了。
史可法出任巡漕參政，馬士英出任督催參政，粟建成出任押運參政，三人的品階皆為從三品。
梁興力出任巡漕御史，趙單羽出任督催御史，兩人的品階皆為正七品。
曹馳出任巡漕主事，顧夢麟出任倉場主事，文坤出任漕運總督府知事，三人的品階皆為正八品。
馬祝葵出任淮安府知府，羅昌洛出任揚州府知府，李長順出任廬州府知府，黃輝旭出任鳳陽府知府，馬代坤出任徐州知州，李攀龍出任山陰縣知縣。
鄭錦宏兼任衛漕都指揮使。
史可法原為西安府知府，馬士英原位延綏巡撫，粟建成原為秦王府長史司長史，其中的史可法和馬士英，是鄭勛睿早就想著帶到淮安的，至於說粟建成，那是他與秦王朱存樞之間的秘密協定，團結一切可以團結的力量，這是鄭勛睿的風格。
梁興力和趙單羽，兩人以前分別是溧水縣主薄和句容縣主薄，正八品，這次調整為巡漕御史和督催御史，成為正七品的官員，連升兩級。
曹馳和顧夢麟，以前就是陝西巡撫衙門的知事，此次跟隨到淮安來，出任巡漕主事和倉場主事，表面上看還是正八品，但職責完全不一樣了，特別是顧夢麟，要知道漕運的倉儲事宜，都是倉場主事直接管轄的，官雖然不大，權力不小。
馬祝葵、羅昌洛、李長順、黃輝旭、馬代坤和李攀龍等人，都是鄭勛睿擔任延綏巡撫時候的得力幹將，此次全部抽調到