科只是時間問題。然而蘇軍在莫斯科城兩個月的頑強抵抗也發揮作用，並造成德軍的軍事計劃推遲。另外德軍在其他戰場進軍受阻，進攻腳步開始緩慢。
而就在這個時候外蒙發生了鉅變，這是斯大林根本沒有預料到的變局。當天上午以巴托爾為首的外蒙大呼拉爾革命黨，宣佈巴托爾臨時擔任革命黨出席，並號召全蒙人民保持克制。與此同時，活佛和庫倫有實力的王爺也紛紛表示支援巴托爾，頃刻之間，外蒙高層變了顏色。
朱日成官邸，諸葛韜對趙猛和早就調到庫倫一支騎兵部隊的指揮官說：“立即控制庫倫，並以公開名義抓捕喬巴山的爪牙，現在巴托爾已經穩定了其黨羽，庫倫外面的蒙軍也被我們控制，現在接管庫倫正是時機。朱日成說：“對於那些不軌之徒，一定要格殺勿論，我們的騎兵大部隊估計兩天能到達庫倫，庫倫內的蘇軍不用擔心，主要是防備蒙軍叛亂。”
緊急回到重慶次日，穆亞平驅車前往外交部。此時副外長周恩來已經站在門外焦急的等候多時了。見穆亞平鑽出轎車，周恩來忙上前說：“穆副總司令，蘇聯大使對於我出兵外蒙提出強烈抗議，他要求我們撤兵，外蒙的事情由外蒙自治政府自己解決。”穆亞平說：“箭已出玄，豈能收回來！”
一見到臉色扭曲的蘇聯大使，沒等穆亞平見禮，身材高大的蘇聯大使就大聲用英語喊道：“穆將軍，中蘇兩國一向友好，我們蘇聯始終站在中國的立場上發展兩國關係。目前我們同處在反法西斯戰線，貴國政府在我方艱難時期出兵外蒙，違背了國際主義準則，完全是強盜行為！”
穆亞平不客氣說：“大使先生，我的副外長以及照會貴國，為了有效打擊日軍，我們準備借道外蒙用兵。可是如此舉措被你們一口回絕了，談什麼一向友好？現在外蒙又出現危局，外蒙自治政府要求我出兵穩定局勢，怎能說是強盜行為？請問我們什麼地方違背了外蒙人民的意願？”
蘇聯大使無言以對，這時一名蘇方人員從外面急匆匆而入，接著把一封電報交給蘇聯大使。電報是斯大林本人直接發來的。內容是：“戰時吃緊，顧全大局。要求切不可與中方發生任何重大矛盾。外蒙問題必須和平解決，並和中方就外蒙問題簽訂一份協議！”蘇聯大使看完電文，知道斯大林把燙手的山芋交給了自己。
蘇聯大使沉吟了一下態度緩和說：“穆將軍，我們接受中國軍隊進入外蒙穩定局勢，但是前提我們必須簽訂一份，有關外蒙在戰爭結束後，中國承諾撤出全部軍隊，尊重外蒙古人民自己選擇的權力，這是我國政府的最後底線！”
穆亞平聞聽心裡樂了，什麼狗屁協定，協定是用來約束的也是用來撕毀的。穆亞平毫不猶豫說：“大使先生，我們完全站在外蒙古人民的立場上，這一點我代表中國政府鄭重承諾。我們副外長全權負責和貴國簽訂協議，有關協議內容，我們會尊重貴國的建議。但是我有一個要求希望貴國政府答應，此份協議秘密簽訂生效後不可公佈，為了有效地打擊日軍，為了達到戰役隱蔽性，我們準備由外蒙東部出兵。”蘇方大使沉吟了一下，考慮到在東北消除日軍的威脅絕對是大好之事，遂表示同意。
當天下午，在莫斯科東部的客山，蘇維埃政府臨時所在地，一座巨大的地下掩體內，蘇軍最高指揮部裡，電報聲不絕於耳。本來斯大林親自坐鎮堅守莫斯科，可是德軍還是頑強的攻入並且兵蜂不可阻擋。斯大林被迫下令撤出。好在經過頑強防守，大量重要工廠以及陸續向東部轉移，德軍隨著節節抵抗，隨著戰線深入，進攻的腳步開始延緩。
關鍵是嚴寒的冬季，給德軍的進攻帶來了很大的困難，德軍賴以突擊的坦克部隊，機動作戰能力下降。因此德軍除了在南部戰線攻勢猛烈外，就是莫斯科的巷戰，坦率說德軍佔領莫斯科這剩下時間問題了。