道的叢林中觀察自然，並透過收藏而謀生。”與達爾文一樣，常年的海外野生動植物考察改變了他對自然界的看法，四年後，*帶著他的收藏品回到英國，然後又到馬來亞叢林中繼續從事他的職業博物學家生涯，前後共8年。在此期間，*形成了他的進化論思想並撰寫了相關論文寄回國內，1858年6月18日，達爾文看到了*的手稿，他寫到：“我從來沒有見過如此驚人的巧合。”*手稿的出現促使達爾文加快編寫並出版了他的著作，這就是《物種起源》。物種起源發表後引起轟動，它解釋了生命進化的規律，將生物學從神學的陰影中拉了出來，成為一門科學。
在達爾文和*研究生物進化的同時，在微生物領域也取得極大進展，1590年，荷蘭光學家詹森，發明了顯微鏡，顯微鏡的發明使科學家們手中又多了一個利器，1650年，荷蘭科學家文虎克對顯微鏡進行改造，把放大倍數提高到270倍，從此，人類進入了微生物和細胞的世界。（見歐洲的文藝復興和大航海時代（六））到了工業革命時期，巴斯德取得了巨大進展，路易斯&；#8226；巴斯德，法國微生物學家、化學家，近代微生物學的奠基人。像牛頓開闢出經典力學一樣，巴斯德開闢了微生物領域，巴斯德一生進行了多項探索性的研究，取得了重大成果，是19世紀最有成就的科學家之一。他用一生的精力證明了三個科學問題：（1）每一種發酵作用都是由於一種微菌的發展，這位法國化學家發現用加熱的方法可以殺滅那些讓啤酒變苦的惱人的微生物。很快，“巴氏殺菌法”便應用在各種食物和飲料上。（2）每一種傳染病都是一種微菌在生物體內的發展：由於發現並根除了一種侵害蠶卵的細菌，巴斯德拯救了法國的絲綢工業。（3）傳染病的微菌，在特殊的培養之下可以減輕毒力，使他們從病菌變成防病的疫苗。他意識到許多疾病均由微生物引起，於是建立起了細菌理論。巴斯德認為病因在於細菌，那麼顯而易見，只有防止細菌進入人體才能避免得病。因此，巴斯德強調醫生要使用消毒法。向世界提出在手術中使用消毒法的約瑟夫&；#8226；辛斯特便是受了巴斯德的影響。巴斯德還發明瞭最早的狂犬病疫苗，為免疫學的發展打下了基礎。
當達爾文發現進化論之後，生物到底是如何進化和繁衍的成了一個新課題，最早在這方面做出貢獻的是奧地利神甫孟德爾，與達爾文一樣，孟德爾所受到的教育是教會式的，不過他的興趣很顯然在種植和農業上面，1856年，從維也納大學回到布魯恩修道院後不久，孟德爾就開始了長達8年的豌豆實驗。孟德爾首先從許多種子商那裡，弄來了34個品種的豌豆，從中挑選出22個品種用於實驗。它們都具有某種可以相互區分的穩定性狀，例如高莖或矮莖、圓料或皺科、灰色種皮或白色種皮等。孟德爾透過人工培植這些豌豆，對不同代的豌豆的性狀和數目進行細緻入微的觀察、計數和分析。8個寒暑的辛勤勞作，孟德爾發現了生物遺傳的基本規律，並得到了相應的數學關係式。人們分別稱他的發現為“孟德爾第一定律”和“孟德爾第二定律”，它們揭示了生物遺傳奧秘的基本規律。但孟德爾的理論沒有引起人們的重視。1900年，在孟德爾去世16年之後，孟德爾的理論被人們重新發現，又過了20年，達爾文主義和孟德爾主義的開始融合並在此基礎上誕生了現代進化論的理論基礎。
這一時期生物學的發展將生物從神學中解放出來，生物不再是什麼高不可攀的東西，而是與大自然中的任何物體一樣的東西，同理，人類也不是什麼特殊的東西。從這個時候開始，上帝就已經死了，當人們站在一種冷酷而客觀的角度來看待人類和人類社會的時候，就象觀察螞蟻和蜜蜂一樣，新的思想也誕生了，由於醫學的發展，以科學的眼光來看，人類在生理和解剖結構上與生物