劉愈把前面捉拿三清教教徒的事安排的差不多，剩下就是如何處置教徒的問題，對於一些能“幡然悔悟”的教徒，劉愈自然會以正常的方式，赦免他們的“罪行”，來達到分化三清教教徒，令他們中更多人可以脫離邪教的影響。不過對於那些頑固不化的教徒，劉愈便沒打算輕易放過他們，劉愈已經決定在城中增加幾個牢房和大獄，專門囚禁三清教教徒，並派出一批人來“教化”他們。
特別時期，用特別的手段。劉愈知道什麼是野火燒不盡春風吹又生的道理，要打擊三清教，就要醜化其，到令其如老鼠過街人人喊打一般，就算是他們鼓動的一些向善的內容，也一概要予以否定，令百姓覺得那就是迷信而不切實際的。宗教的東西，要剷除之，不怕沒有理由，劉愈相信，只要輿論工作做的足夠好，那好的也能說成是壞的，更遑論，三清教本來就是披上一層西方宗教皮的邪教，本身就有其固有的弱點，朝廷要打擊其存在性更是不在話下。
對三司的人，劉愈有特別交待，教徒從京兆府和防司衙門拘押，轉接到刑部和大理寺，對其定罪，劉愈覺得應該妥當，首先不能太嚴厲，直接定其死罪。劉愈也知道何為懷柔，也知道教徒中很多是不明真相的普通百姓，劉愈對這些落罪的教徒，也有感化的誠意。因而在這點上，劉愈對三司的人也有特別交待。
“……凡教徒中，分數等，若遇附庸者，可既往不咎，令其回家，每日到衙門備查便可。對於一些傳教者，則當單獨拘押，防止其蠱惑人心。而對於主事者，則嚴懲不貸……”
召見完三司的人，劉愈馬上召集在長安城周圍兩大營，南長安大營和東水營將領，以及在長安城重要將領，諸如霍病等人。
對於地方守備營，劉愈下達的旨令是協助地方衙門，剷除邪教。而對於長安城周邊的戍衛軍隊，劉愈則下令一切以安定為主。同時，劉愈也讓兵部嚴查軍中所存在的傳教現象，杜絕三清教在軍中有任何的發展。
會議一直開到後半夜，等琪兒都困困欲眠時，劉愈還依舊在跟下面的官員開會商討。等最後，韓升和隋妤將臨時修改好的，剷除三清教的政令遞交到劉愈手上看，已經是到丑時。
劉愈見政令並無偏差，閉眼思考了一下還有何遺漏的地方。想了會，睜開眼，讓韓升和隋妤把政令拿回去，連夜從朝廷下達到地方。
等這一切都辦完，琪兒已經靠在軟枕上睡了一個多時辰。
“起來，回內廷了。”辦完這些事，劉愈拍拍琪兒的臉，琪兒悠悠轉醒，睡眼朦朧地看看周圍，已經只剩下劉愈和幾個女官。
“相公，完事了嗎？好睏……”
“外面風大，在這裡睡你就先睡吧，等天明再回內廷。”
劉愈讓琪兒繼續在雅前殿暖炕上睡覺，親自給她披上被子，讓女官好好照看，而劉愈則連夜出宮，往外宅柳麗娘居所方向而去。
到柳麗娘處，劉愈直接到後院找柳麗娘，而柳麗娘也是在睡夢中被丫鬟叫醒，也是一副睡眼朦朧的狀況。不過她與琪兒不同，柳麗娘畢竟知道輕重，就是再困，她也知道劉愈深夜來訪定然有大事，無事不登門。
“十二少，你心急火燎的來，開始朝廷著火了？”柳麗娘到桌前，給劉愈倒了一杯茶，帶著點醋意問道。
劉愈一笑，把此行的目的說出來。
“麗娘，這次我來，就是告訴你，一清早，朝廷就會正式頒佈政令，宣佈三清教為邪教，同時朝廷會以各種手段，來杜絕三清教在關中及地方上的發展。”
柳麗娘攤攤手，好像在說，這些跟我沒關係。
劉愈再一笑，道：“找你，想讓你幫忙做一件事，就是利用你的一批人，來監視朝廷中官員的一舉一動，看看他們當中，有多少人跟三清教以及楚王有不明的勾結