自此一戰，西秦兵五萬主力盡失，只有大將慕兀還有兩萬軍隊在柏陽。乞伏乾歸手下諸將都建議憑著這點兒家底再跟後秦決一死戰。乞伏乾歸說：&ldo;現在的形勢我們再戰也只能失敗，不如投降還能儲存實力。如果天不亡我，將來說不定還能復國。如果再戰，只能拼光家底。&rdo;後來乞伏乾歸果然復國。
乞伏乾歸投降了後秦，被姚興任命為河州刺史、歸義侯，仍然讓他率舊部鎮守苑川。這時後秦的目標又轉向了涼州。西涼國李暠、北涼國沮渠蒙遜、南涼國禿髮利鹿孤為了讓姚興不打自己，都派使臣向姚興稱臣，並且一致說後涼的壞話，稱後涼內部不團結，兄弟之間殺來殺去，老百姓也不得安寧，正是攻取後涼的好時機。於是姚興派姚碩德為帥率軍六萬進攻後涼姑臧，乞伏乾歸率一萬騎兵助戰。
呂隆的兩個弟弟呂超、呂邈舉傾國之兵出戰。其實後涼也只剩下姑臧、昌松、番禾三郡了，舉國之兵也沒多少。兩軍在姑臧城下決戰，後涼軍大敗。呂邈被擒，呂隆和呂超帶敗軍回城。總算是姑臧經過幾代人數十年經營，城高牆厚，戰略物資儲備也豐富。後秦軍圍城四個多月，竟然不能破城。姚碩德很是鬱悶，幸好後涼將姜紀投降，並向姚碩德獻策說：&ldo;呂隆孤城無援，早晚要耗盡儲備。您把糧草堆成山一樣高，再在城周圍蓋房子，開墾田地，就好像在城外永遠住下去一樣。呂隆肯定害怕，不久就會投降。&rdo;姚碩德依計而行，呂隆果然害怕，這時呂隆叔父、巴西公呂佗也帶著東苑二萬五千兵出城投降了。呂隆終於下了決心出城請降，姚興命呂隆為鎮西大將軍、涼州刺史、建康公，仍然鎮守姑臧。但姜紀對姚碩德道：&ldo;呂隆雖然降了，只是文降，手裡仍有兵權，將來有一天恐怕會找機會反叛。&rdo;於是姚碩德向姚興請示後，任命姜紀為武威太守，配騎兵三千，在晏然駐兵；又以焦朗為魏安太守；並把除呂隆外的所有呂族子弟及文武舊臣全部遷到長安作為人質。至此，南涼、北涼和西涼向後秦稱臣，西秦和後涼被後秦攻滅，吐谷渾和後仇池也向後秦稱藩。後秦遂統一西部。
這時北部的魏國和後秦發生了矛盾。拓跋鮮卑有個風俗：凡立皇后，必須先鑄金人像，如果金像成，才能冊立此人為皇后。拓跋珪先娶劉庫仁的弟弟劉頭眷的女兒，夫妻兩人相處得非常好，生兒子為拓跋嗣。後來攻下中山城後，拓跋珪得到慕容寶的小女兒慕容氏。因為慕容氏年輕貌美，拓跋珪也很喜歡她。魏天興二年（399）三月，拓跋珪要冊立皇后，於是按照風俗，為劉氏和慕容氏分別鑄金人像，結果慕容氏的金像成了，而劉氏的沒有成，所以立慕容氏為皇后。不久，拓跋珪又聽說後秦姚興的女兒美貌，遂派北部大人賀狄幹獻給後秦一千匹良馬作為聘禮向姚興求婚。姚興問賀狄幹：&ldo;拓跋珪立了皇后沒有？&rdo;賀狄幹回答：&ldo;已經立慕容氏為後。&rdo;
姚興聽了很生氣：&ldo;既然拓跋珪已經立了皇后，又來求婚做什麼？難道讓朕的女兒給他做小老婆麼？&rdo;不但不答應這門婚事，還把賀狄幹給關起來了。
拓跋珪大怒，於是派常山王拓跋遵率軍五萬，去攻打後秦的高平（今寧夏固原）和朔方（今陝西延安）。鎮守這兩個地方的是劉衛辰的兒子劉勃勃。當年拓跋珪攻滅劉衛辰，把劉衛辰的全家都殺了，只有劉勃勃一個人逃出。劉勃勃先投奔薛幹部，拓跋珪讓薛幹部的首領太悉交人，太悉拒絕，拓跋珪就把薛幹部滅了，殺了太悉。劉勃勃遂又逃到後秦的高平川，投奔高平公沒弈幹。沒弈幹很喜歡劉勃勃，把自己的女兒許配給他，又引薦給姚興。姚興和劉勃勃談了談，覺得這個人很有才，於是任命他為驍騎將軍，加奉車都尉，並讓他參與軍國大政。不久又任命劉勃勃為安遠將軍，派給他三萬士兵，幫助沒弈幹