從此，董卓不僅控制大量常規部隊，而且還掌握著洛陽的直屬部隊，完全具備了左右朝政的軍事基礎。這為他的野心進一步膨脹增加了相當分量的籌碼。
當時，鮑信就對董卓軍事勢力的膨脹有較清醒的覺察和認識，他曾對袁紹說：「董卓擁有強兵，素有野心，如果現在不想辦法除掉他，今後必將受其牽制。如今董卓軍隊人員混雜，軍心不穩，組織不嚴，正可趁早除掉。」可是袁紹因懼怕董卓，優柔寡斷，未採取行動。
有了強大的軍事後盾，董卓便有恃無恐，為所欲為。首先他迫使朝廷免除司空劉弘的職務，自己取而代之。接著，為了進一步獨攬中央政權，董卓決定召集文武百官商議廢除少帝，另立新皇帝。
在一次會議上，董卓肆無忌憚地說：「少帝愚昧懦弱，不能敬奉宗廟，沒有資格擔任天下的君主。為了國家和漢室江山著想，我想效法伊尹放太甲，霍光廢昌邑的故事，廢掉少帝，改立陳留王劉協為天子！」
在場官員大多懾於董卓的淫威，對他獨斷專行、隨心所欲的行為敢怒不敢言。只有尚書盧植當面提出反對意見，認為少帝只是年紀幼小，行為品性根本就不能與太甲和昌邑王相提並論。
董卓大怒，沒想到盧植如此不敬，膽敢當眾反對自己，便立即命令士兵將他推出斬首，幸虧侍中蔡邕極力勸阻，盧植才免於一死。
之後，董卓廢掉少帝，將他貶為弘農王；另立陳留王劉協，即為漢獻帝。
廢立皇帝之後，董卓又對何太后看不順眼，認為她有礙自己在朝廷上下自由行動和樹立威信。
於是，董卓又大會群臣，向大臣們數落太后所謂的罪行，說她如何如何逼迫婆母永樂皇太后（靈帝劉宏的母親），以致皇太后憂慮而死。
這種違背婆媳常理、不講孝順禮節的教法，應當受到嚴厲懲處。之後，董卓便責令何太后遷居永安宮，不久，董卓又藉故殺死少帝劉辯，毒死何太后。
透過對中央政權最高階層人員的更換和處理，整個東漢政府幾乎完全受制於董卓：皇帝的廢立、朝臣的任免、重大政策的制定，都由董卓說了算。此時，野心極度膨脹的董卓，已經目空一切。
改立獻帝之後，董卓將自己升遷為太尉，成為三公之一，掌管全事和前將軍事務，後又自封郡侯，拜國相，躍居三公之首，掌宰相權。
董卓雖然名為「一人之下，萬人之上」的國相，但實際上卻遠遠超越皇帝，享有「贊拜不名、入朝不趨、劍履上殿」等特權。
一人得道，雞犬昇天。自己加官進爵後，董卓還利用自己手中的特權，大肆加封董氏家族成員。他首先封自己的母親為池陽君，越禮配備家令和家臣，地位與皇家公主相當。
同時，董卓又拜弟弟董旻為左將軍，封雩侯，另外還封自己年幼的孫女為謂陽君。更有甚者，「卓侍妾懷抱中子，皆封侯，弄以金紫」。
為了更有效地控制皇帝，董卓不顧朝臣反對，脅迫獻帝將都城從洛陽西遷至長安。
董卓還無視禮制和皇威，在自己的封地修築了與長安城牆規模相當的塢堡，高厚達七丈，明目張膽地用「萬歲塢」來命名，並規定，任何官員經過他的封地時，都必須下馬，恭恭敬敬地對他行大禮。
初到洛陽時，董卓手下雖然也集結了一批心腹親信，但是，要在龐大的中央官僚體系中縱橫捭闔，單靠這些人是遠遠不夠的。
況且當時朝中許多有一定勢力和影響的官僚，根本就不服董卓。對此，董卓在玩弄權術的過程中，暗中培養爪牙，廣為收羅親信，用拉攏、誘惑、排擠等手段打擊和陷害一切於己不利的勢力和集團。
封侯後，董卓極力拉攏司徒黃琬，司空楊彪，抬舉和扶植已被貶斥的陳蕃、竇武等人。
董