公元656年奧斯曼？伊本？阿凡遇刺，其堂弟敘利亞總督穆阿維葉反對先知的侄子和女婿阿里？伊本？艾比？塔裡卜繼任哈里發，從而引起大規模內戰。
穆阿維葉系穆罕默德傳教時代的宿敵阿布？蘇富揚的兒子，在630年麥加被穆罕默德佔領後與父親一起皈依伊斯蘭教。他於633年參加伊斯蘭軍隊對敘利亞的征服之戰，戰後成為大馬士革總督。後來穆阿維葉在其堂兄奧斯曼任哈里發時代獲得對整個敘利亞的統治權，他完全把敘利亞當作自己的私人領地來經營。
穆阿維葉在657年的隋芬戰役中依靠“神裁”的方式戰勝阿里，並在阿里於661年被刺殺後壓服反對者，成為哈里發。
公元679年，穆阿維葉一世宣佈其子葉齊德一世為哈里發繼承人，從而將哈里發的選舉制度破壞，從此阿拉伯帝國成為一個由世襲王朝統治的封建國家。
倭馬亞王朝的建立伴隨著其最大的反對者伊斯蘭教什葉派的興起，什葉派不承認倭馬亞王朝的哈里發地位為合法，堅持哈里發一職只能從先知女婿阿里的後代中產生。
由於阿里的長子哈桑主動放棄哈里發地位並於穆阿維葉一世統治時期被毒死，什葉派轉而支援阿里的次子侯賽因成為哈里發。侯賽因在682年於庫法附近被倭馬亞王朝軍隊殺害，使什葉派極為震怒。
阿卜杜拉？伊本？祖拜爾強烈反對倭馬亞王朝，他實際上佔領了阿拉伯帝國境內的很多地區，並於漢志的麥加建立了自己的政權麥加獨立，自稱哈里發，並得到阿拉伯半島和伊拉克等地反倭馬亞政權的各派勢力支援，也就是被中國史書稱為的黑衣大食。
黑衣大食和白衣大食之間的爭鬥，一直持續到哈里發阿卜杜勒？馬利克時代，倭馬亞王朝才消滅了麥加的什葉派政權。
在整個倭馬亞王朝時期，政府與什葉派一直髮生戰鬥，但什葉派從未被徹底剪除。而且什葉派也最終協助阿拔斯王朝終結了倭馬亞家族的統治。
在倭馬亞王朝時代，阿拉伯帝國的對外征服達到了另一個高峰，他們的疆域最廣闊之時，東至中亞、西至西班牙。
穆阿維葉繼任哈里發以後不久，就調兵遣將，東西兩面出擊。哈賈傑？本？優素福在阿卜杜勒？馬利克時代率領阿拉伯軍隊向中亞挺進，東線大軍於664年佔領阿富汗首城喀布林，然後揮師北上，侵入中亞。先後征服布哈拉、撒馬爾罕和花剌子模等廣大地區，直至帕米爾始為唐軍所阻，而阿拉伯人的宗教最終永遠地征服了這一地區。
與此同時，東方戰場的另一支阿拉伯軍隊，哈賈傑？本？優素福的侄子穆罕默德？伊本？卡希姆則南下攻入印度，迅速征服了信德和旁遮普地區，標誌著伊斯蘭教從此在印度紮根。
在北方，阿拉伯軍隊曾三次進攻君士坦丁堡，由於拜佔廷皇帝立奧三世利用君士坦丁堡天險和秘密武器“希臘火”抵抗，而未能得手。
在西方，阿拉伯人消滅了拜佔廷的北非駐軍，佔領從突尼西亞直到摩洛哥的馬格里布。阿拉伯人使當地的摩爾人很快改宗伊斯蘭教，並以他們為主力部隊，跨越直布羅陀海峽進攻西班牙。
公元711年，倭馬亞王朝的埃及總督穆薩？伊本？努塞爾手下的摩爾人將領塔裡克？伊本？齊亞德率領穆斯林軍隊渡過直布羅陀海峽進入伊比利亞半島，不久穆薩？伊本？努塞爾本人率領更多軍隊趕到，兩位將軍攻佔西班牙三分之二的領土，征服了日耳曼人的西哥特王國，建立安達盧斯王國。
並在公元732年，穿越比利牛斯山，進攻法蘭克王國，由於到達了其擴張的極限，在普瓦提埃戰役為法蘭克王國宮相矮子丕平所敗，當然現在這一事件已經不可能發生了。
至此，倭馬亞王朝時代的阿拉伯人基本上結束了大規模的征服運動