月18日赴昆明的。陳佈雷身是在四川，遠離家鄉數千里，隔萬重山，心猶繫念家鄉，3月21日日記中記：&ldo;……閱報知十九，二十日，日艦在鎮海口外發炮數百響，並窺視餘姚洋麵，想吾甬人心極震動，遙念家鄉，懸系不止……&rdo;
在重慶時的蔣介石與陳佈雷(1)
1939年元旦，國民黨中常委舉行臨時會議，討論對汪精衛&ldo;艷電&rdo;之處置。
蔣介石說：&ldo;除夕之日，我已囑佈雷擬電稿，曉汪以大義，為留悛悔餘地……&rdo;
抗戰時期的宋美齡他話還未講完，林森氣呼呼地說開了，這位老先生講話從來是很穩重的，可是這次很激動。林森還未講完，張繼、吳稚暉也憤慨陳詞。會議決議永遠開除汪精衛
的黨籍，並發表決議文&ldo;昭告全國，以明邪正&rdo;。
1月下旬，國民黨召開五中全會，在全會期間，蔣介石出席演講六七次，陳佈雷整理講詞記錄，都做到了隨到隨辦，毫無滯留；又參加了宣言起草(戴季陶主持)。二三月間，為蔣介石撰擬文字最多，如《行的道理》、《政治的道德》及《三民主義之體系與實施程式》等。其他各種紀念文字如《新運週年紀念》等，也寫得不少，寫來也覺順利，勝任愉快。
在重慶期間，陳佈雷有幾次休養。第一次是1939年4月以後，他體力不支，精神疲憊，但以工作繁忙，未便請假，可是蔣介石夫婦倒看出來了。有一天，宋美齡親自對陳佈雷說：&ldo;陳主任，你身體不好，不要硬撐，主席很不放心，囑我告你，是不是易地療養?是不是到昆明去休養?那邊氣候好。所有休養費用，交通工具，我會關照的。&rdo;
陳佈雷感激涕零，只是說：&ldo;多謝蔣先生和夫人關心，去昆明太遠，萬一蔣先生有事，恐有不便。&rdo;
一直到5月7日，宋美齡又親至美專街，還帶來了蔣介石的一封親筆信：&ldo;移地療養不便，可在近郊療養，修書敦促，請即離渝，保重身體。&rdo;
陳佈雷到重慶近郊北碚休養去了。他在回憶中說：&ldo;5月8日到北碚，12日移往縉雲山中之石華寺。縉雲山原有相思寺，系唐時古剎，近年設漢藏教理院，由太虛法師之徒法尊任院長，彼此有交誼，餘乃賃其別院之石華寺東廂以居，凡休養五十二日。其間即在山中為蔣公補輯民國十六年以來各年之日記，蓋原本藏置地下室，日久為水浸入有剝蝕者，蔣公命餘為之整理並督查補重訂，凡六週而畢事。又為蔣公撰《科學的群眾時代》之講演，並複閱訓練團講稿多篇，雖在休假中亦有相當工作，然山中氣候涼爽，每日必外出散步，居月餘，諸患漸除，乃於6月30日下山回渝銷假。&rdo;
7月初旬，陳佈雷精神復原，又為蔣介石撰擬並修改了抗戰二週年《告全國軍民書》、《告友邦人士書》、《告日本民眾書》及激勵將士通電和若干對外函札等。
1939年12月26日，陳佈雷50歲生日，蔣介石給陳佈雷寫了&ldo;寧靜致遠澹泊明志&rdo;的祝詞後，陳佈雷道謝。這時，蔣介石告訴陳佈雷一件事：
&ldo;接到經國電報，日機在農曆十一月初二轟炸溪口，以豐鎬房和文昌閣為主要目標，經國的母親、我的外甥宋漲生、教過方良（經國妻）國語的董先生都被炸死。經國奔喪回贛後來過電報，其母滿七時（即死後七七四十九天），經國又去溪口，住武嶺公園中國旅行社，不料被潛伏的日諜偵悉，正月初二又出動大批日機，狂炸武嶺公園……&rdo;