此時鄭經仍然駐留在廈門，還未收到父親病危的訊息。在臺灣的黃昭以鄭經得罪鄭成功，沒有資格繼承鄭氏王朝，聯合其他將領，擁立鄭成功的五弟鄭襲代理招討大將軍。訊息傳到廈門，鄭經宣佈自己為嗣封世子。鄭氏王朝因此分裂為二。
此時鄭經為瞭解除清軍的威脅，提出將鄭氏王朝加入清朝的朝貢體系，但仍保留政府、軍隊，派使者前往北京和康熙帝交涉，並且請求與清軍停戰，以此來獲得討伐叔父鄭襲地時間。若是按照歷史的發展，鄭經將會親自派遣艦隊襲擊臺灣並且在禾寮港上岸奪回鄭氏集團內部的統治權。由於這場內鬥，鄭氏集團的老巢金門、廈門二島也將在次年開春被滿清與荷蘭人聯手攻破，鄭氏集團開始盤踞臺灣近半世紀之久。
可是這個時候歷史卻發生了偏差，由於荷蘭人在南洋陷入困境，兩隊荷蘭荷蘭使團分別抵達福建和廣東，與耿精忠、尚可喜二人交涉………
九月二十五，留守廈門的鄭經得到了叔父鄭襲自立為招討大將軍地訊息。立即下令廈門、金門兩島的鄭軍向臺灣進發。艦隊走到一半，又傳來了一個更加驚人的資訊，耿精忠、尚可喜各率兩萬大軍借的荷蘭船艦已在臺灣港口登陸，並且大敗了叔父鄭襲的軍隊，一直龜縮在荷蘭據點中的荷蘭士兵也趁機反攻，在臺中一帶擊潰臺灣鄭軍，鄭襲的中軍已被滿清、荷蘭大軍團團圍住。
鄭經很清醒，臺灣已經完了。他地那個叔父也完蛋了。他顧不得去襲擊自己的叔父，連忙率艦隊退回金門島。此時的他，猶如熱鍋的螞蟻一般。原先還恨不得將這個篡位的叔父碎屍萬段，現在卻巴不得他能夠多活一時是一時，否則主島臺灣淪陷，單憑廈門、金門兩個小島如何抵禦清軍與荷蘭人的攻勢？
到了九月二十九日，鄭襲全軍覆沒，在亂軍中被清軍殺死的訊息傳來，鄭經這才慌了手腳，如今上有百萬清軍磨刀霍霍，下有臺灣地滿清、荷蘭聯軍隨時北上，自己守在這兩個彈丸島嶼上，手下海船不過一百，兵丁不過萬人，拿什麼去抵抗。失去了臺灣地金門、廈門兩個島嶼立時成了死地，別說反清，恐怕連自保的可能性都沒有。
一場鄭氏內部的討論迅速的展開，幕僚們大多對時局灰心喪氣，勸鄭經向滿清投降。鄭經端坐著一動不動，心裡卻是發出冷笑，投降？就算新始皇帝可以投降滿清，而鄭經卻是萬萬不能降清的，不說他的祖母被清軍姦殺，他的爺爺鄭芝龍倒是向清軍投降了，一樣被清軍處死，鄭氏與滿清是不共戴天的仇人，更何況鄭經投降之後定然也是死路一條，滿清是不會相信他地忠誠地，這些幕僚之所以相勸，不過是想保住自己的性命而已，這個時候哪裡還有功夫為自己地主公考慮。
這個時候，一個中年儒生厲喝一聲：&ldo;天下人皆可降清，唯獨延平王絕不可降，請延平王將這些怕死之徒全部拉下帳去斬首，否則任由他們擾亂軍心，鄭氏亡矣。&rdo;
鄭經循聲望去，認得說話的這人正是參軍、天地會總舵主陳永華，陳永華原本與鄭成功一直駐留在臺灣，鄭成功病危時曾拉著陳永華地手讓他定要輔佐世子鄭經即位，哪裡知道鄭成功屍骨未寒，鄭成功的五弟鄭襲便在一幫臺灣將領的擁戴下自立為王，陳永華知道大事不妙，連夜在會眾的安排下乘船回到廈門，打算與鄭經一起討伐鄭襲，哪知形勢急轉直下，不到半月的功夫，臺灣淪陷。
&ldo;原來是陳先生。&rdo;鄭經面露喜色，他並不是個傻子，這麼些人中，只有陳永華的話才是真正的為自己考慮：&ldo;陳先生可有何策？小王洗耳恭聽危難之下，鄭經的語氣也客氣了許多。
&ldo;延平王，在廈門和金門，我們還有軍民十萬人，各種戰艦、商船數百艘，再加上南洋威懾荷蘭人的艦隊也