當時最大的客戶，用該系統和定製軟體完成二維動畫中非常費力的填色工作。該系統銷路一般，為了更好地推銷，皮克斯僱傭了約翰…雷斯特，由他執導製作了《小檯燈》等動畫短片來展示電腦動畫的實力，並將這些動畫短片在上展示。
由於電腦業務不利，約翰…雷斯特領導的動畫部門開始為其他公司提供電腦動畫製作服務。同時皮克斯保持了同迪斯尼動畫緊密聯絡。一九九一年，在公司一次大裁員之後，接到了迪斯尼動畫的一個訂單。迪斯尼動畫作為製片方投資兩千六百萬美元，由皮克斯製作三部電腦動畫，第一部為《玩具總動員》。儘管得到了迪斯尼的訂單，由於長期不能盈利，史蒂夫…喬布斯最終還是決定出售皮克斯。
直到迪斯尼同意將玩具總動員推到一九九五年的暑期檔發行之後，喬布斯才決定暫停出售，給皮克斯最後一個機會。只是令所有人沒有想到的是，《玩具總動員》播出之後竟然大獲成功，全球票房達到三億五千萬美元這才讓史蒂夫…喬布斯放棄了出售皮克斯的計劃，轉而專心的與迪士尼合作，搞起動畫來。
不過，據艾克曼所知，雖然在去年上映的《玩具總動員》票房大賣，但是皮克斯實際上並沒有賺多少錢。因為《玩具總動員》雖然是皮克斯製作完成的，不過，這部長片動畫卻是迪士尼委託皮克斯製作的，就是說這部動畫的版權屬於迪士尼，皮克斯不但得不到動畫周邊所產生的利潤，在票房方面，他們也得不到任何分成，只能拿合同中規定的製作費而已
皮克斯仍然一如既往的處在缺少資金的尷尬狀態。雖然如此，史蒂夫…喬布斯卻看到了希望，憑藉《玩具總動員》打出的知名度，史蒂夫…喬布斯隨即把皮克斯上市，以此達到籌措資金的目的。果然，上市後，股價在很短的時間裡便翻了一番，史蒂夫…喬布斯如願以償的得到了一大筆資金。
當然，這些並不是艾克曼看上皮克斯的理由，在他的記憶中，皮克斯從明年上映的《棋逢敵手》開始，將會一發而不可收拾，基本上每部動畫長片都會獲得奧斯卡的提名，並且票房也是全部大賣，這簡直就是一個奇蹟
一九九六年，約翰…拉薩特獲得奧斯卡特殊成就獎，《玩具總動員》獲得奧斯卡最佳配樂（音樂喜劇類）、最佳主題曲、最佳原著劇本提名，同年還獲得金球獎音樂喜劇類最佳影片及最佳主題曲提名。
一九九七年，皮克斯與迪士尼達成進一步協議，決定強強聯手共同製作五部動畫長片。皮克斯發行短片《棋逢敵手》，本片在動畫角色的面板及服裝材質上有了很明顯的優勢。
一九九八年，迪士尼與皮克斯合作的第二部電腦動畫長片《蟲蟲危機》上映。《蟲蟲危機》在北美共有一億六千三百多萬美元進賬，全球票房為三億六千二百多萬美元，擊敗了同期推出的夢工廠《螞蟻雄兵》，成為當年動畫長片票房冠軍。同年，《棋逢敵手》獲得奧斯卡最佳動畫短片獎，皮克斯研製的動畫系統和數位繪圖技術獲得奧斯卡科學工程獎。
一九九九年，世界上第一部完全數碼製作的電影《玩具總動員2》上映，在美國、英國、日本等地先後打破首映周票房記錄。這部迪士尼與皮克斯合作的第三部電腦動畫長片的內容及人物都接續《玩具總動員》。憑藉《玩具總動員2》兩億四千五百多萬美元票房的佳績，導演約翰…拉塞特與斯蒂文…斯皮爾伯格、詹姆斯…卡梅隆等並稱為好萊塢最會賺錢的十大導演。同年，《蟲蟲危機》獲得格萊美最佳電影電視演奏配樂獎和奧斯卡音樂喜劇類最佳配樂提名獲得奧斯卡技術成就獎。
二零零零年，《玩具總動員2》獲得金球獎音樂喜劇類最佳影片獎、最佳原創歌曲；格萊美�