勝了他們，那些野蠻人，他們跑了！陛下，他們跑了！”“這怎麼可能？”亞歷山大抬起頭，望向遠處，那些騎兵確實都已消失不見了。他看到整個阿契美尼德軍隊的左翼因為追趕他和夥友騎兵，中央已被扯開了一個缺口。於是他立即上馬，調轉折回，策馬揚鞭，向著皇帝的位置襲去。他孤身一人向前衝去，身後那些為數不多的輕騎兵無法跟上他的步伐；因為他那顯眼的頭盔找不到了，所以敵人並未認出他來，這讓他能夠最大程度的被周圍的人忽視，單槍匹馬，長驅直入。不久後，亞歷山大已非常接近科多曼努斯，直到那時，保衛皇帝的不朽者軍團才意識到這一騎騎兵是一個威脅，並準備上前攻擊。只見亞歷山大從地上拔起一支標槍，向皇帝扔去。科多曼努斯急忙躲閃，標槍擊中戰車的駕駛員，使他倒地身亡。不朽者當中有人驚呼和哀鳴，讓稍遠的步兵團以為是皇帝本人中槍，於是立刻開始潰逃；接著，一小群又一小群的波斯人開始競相逃跑，很快整個大軍風聲鶴唳，直至科多曼努斯周圍的人也都離去。當他發現自己周圍已無人保護，孤立無援，便立即調轉戰車，駛向遠方。亞歷山大怒喊著仇人的名字繼續追趕科多曼努斯，直到身後的人叫住了他。讓他不要遠離戰場，因為馬其頓的左翼和後方都已被敵人攻破，需要他趕去救援。亞歷山大望著科多曼努斯落魄的背影，突然好像釋懷一般平靜地閉上雙眼，放走了他。他掉頭趕回左翼帕曼紐處的時候，阿契美尼德人聽說自己的國王已經逃跑，便紛紛失去了戰鬥的意志，丟盔棄甲，四散而逃。從那一刻起，整個美索不達米亞的腹地，向亞歷山大敞開。
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亞歷山大大帝進入阿契美尼德的行政首都巴比倫，他驚歎於這座城市的恢弘壯麗。他並沒有稱王，也沒有宣佈這個帝國的終結。他甚至把科多曼努斯的家眷接回皇宮，並要求他的將士們繼續對太后西緒甘碧絲和公主帕瑞薩娣絲行波斯人的拜禮（proskynesis）；他入鄉隨俗，穿戴波斯人的服侍，學習波斯人的文化，他剋制自己的言行，讓自己的舉止像一個客人而不是主人。西緒甘碧絲與他相處的十分和睦，便收他為自己的義子。他不要求任何人以波斯國王的禮儀向他叩拜，也禁止他軍隊中的將領和士兵在這片土地上行暴虐和破壞。當他看到那座巨大且早已被遺棄的古老廟宇——埃特曼安吉的時候，他驚詫地說道：“啊！什麼樣的文明能孕育出這樣的奇蹟啊！”並立即下令修復（或重建）它。他保護巴比倫的每一樣藝術品、雕塑和碑刻，嚴懲破壞和偷盜它們的人。亞歷山大如飢似渴地學習和了解波斯人的宗教、神話和歷史，那些馬其頓的將軍們經常找不到他們的國王在什麼地方，因為他終日泡在皇家的圖書館翻閱資料，或是在向祆教的祭司們請教問題，或是在與史官和學士們研討哲學。亞歷山大早已忘卻繼續追殺還在逃亡的科多曼努斯的事宜。亞歷山大詢問祆教學者：“那雄偉的埃特曼安吉神廟建於什麼時候？供奉的是什麼神明？”“陛下，那座神廟建於很久遠以前的時代，恐怕要有幾千年了……具體什麼時候沒有人能夠考證，因為兩百多年前，卡亞尼亞王朝（kayanian dynasty）的先王（居魯士大帝）奪取這座城的時候，它就在那裡了。我們只知道它本來是巴比倫王國時期供奉馬爾杜克神的神壇，其他的都不清楚了……”“馬爾杜克？那你們有誰知道他的故事嗎？”“很抱歉，陛下。我們只知道他是這座城市的古神，他的故事被記在那些有些年頭的泥板上，是用古巴比倫的阿卡德楔形文字雕刻的，今天雖有些地方官還能夠大概使用其中的一些單字，去寫一些官方的書信，但要把這些泥板給他們看，他們既無法朗讀出來，也無法真正看懂其中的內容……明晰那語言的古巴比倫祭司們已經絕跡……所以，今天無人能夠知曉這兩河流域古文明的故事了。”“那你去幫我找來，能認出一兩個單