前，邢家莊外的一條河上，不知從哪裡飄來一具死屍，結果後來，凡是飲用過河水的村民突然便患上了一種奇怪的病症，走起路來如同夢遊一般，整日遊囈不停，直到最後，不眠不休精力衰竭而亡。
莊裡所有人都怖劇不已，染病的人越來越多，後來請來巫師做法也毫無用處，只得全村的人把錢全都拿出來，派遣莊裡的年輕人到外面去尋求名醫。
當時莊裡很多青壯男子大部分已經為怪病所困。
有一位名喚百靈的女子，看到家人被病痛折磨，心中不忍，於是女扮男裝也跑出去請求名醫的診治。
當時她聽說黃藥師的大名，但深知黃藥師一般不會親自出診，但是當時莊裡的情況已經不容許再多耽擱。
於是她悄悄混入黃府之中，幾日之後終於見到傳說中的黃藥師。她只知傳說中的黃藥師為人正派，從不近女色，但又怎會知道，黃藥師不近女色卻是另有隱憂！
黃藥師看他生的面貌清秀，一副惹人憐的模樣，便已對他上了心。
終於一日酩酊大醉之後，竟然強行糟蹋了她！可憐那麼一個姑娘，千辛萬苦只想為村人尋得名醫，卻要付出自己一生的清白！
第二天，趁著黃藥師尚未清醒，她便起床收拾好昨夜留下的殘跡，一片殷紅令她心灰意冷，而支援她繼續活下去的，只有村人的安危！“他”將村人遭遇的怪病對黃藥師細細說完，出於愛憐，黃藥師於是在百靈的帶領下，走到了那個怪病橫行的村莊——邢家莊。
黃藥師不愧為神醫聖手，開出的藥方幾日便令大多數村人恢復了正常。然而隨著村民家人的逐漸康復，百靈求生的意願也越來越弱，最後，終於在要返回黃府的前夜，跳河自殺！
然而這一切，黃藥師卻絲毫不知！
恰好當今的劉府家主路過那條河邊，看到一個清麗身影投河自盡，忙將其救起，並收留在劉府中，百般呵護，並向百靈提出了婚約。百靈初始百般不肯，並向劉家家主講述了自己的經歷，可劉家卻從不嫌棄，反而為她的勇氣折服，待她比往日更好！
白靈終於被他的誠心所感動，兩人最終結為伉儷。
本以為，故事到這裡便有了結局，可誰料，八個月後，百靈便產下了一個男嬰，大家對這個孩子的早產感到驚奇，劉家人自然也不例外，可劉家家主卻依然故我，對白靈依然疼愛有加，甚至對孩子也疼愛不已。
阿德本是邢家莊人，自幼與白靈一起長大，青梅竹馬兩小無猜，本來兩人情投意合，兩家家長也有意令兩人結合，可後來白靈被黃藥師侮辱後，白靈無顏再見阿德。只將一紙書信留給阿德，而後，便投河自盡！
黃藥師返程時，恰好看到相貌秀麗的阿德，便故意用藥迷暈阿德，做了那苟且之事。這時阿德才突然明白，白靈身上究竟發生了什麼事——當日白靈便是穿著自己的男裝走出了村莊——可是，一切都已經晚了，白靈早已不見了……
悲哀的接受白靈消失的訊息後，阿德發誓定要為白靈報仇，於是阿德便隨黃藥師回到黃府，本打算找到機會殺死黃藥師，再自盡身亡，可是……
上天卻讓他在絕望時分，重新看到了白靈。
那時的白靈，已是為人婦為人母，他看到她抱著一個嬰兒走在集市上，對著旁邊的男人開心地笑著，他好像突然看到了希望，活下去的希望！
他偷偷跑到劉府，將從黃藥師手中尋來的超慢性毒藥一點點撒在嬰兒房內的花盆裡，這種藥只要一遇到水，便會隨水一起揮發，這樣被嬰兒吸收到體內，定會引起症狀不明的慢性中毒。這附近的一般郎中對這種病肯定束手無策，終有一日，她會來到黃府，來到他的身邊！
於是他逼迫黃藥師為劉家公子治病，並將解藥交到黃藥師手中。