了這些的地方實力派隨即對天王洪秀全以及北王韋昌輝都失去了信心。
而天王洪秀全此時已經逐漸明白了韋澤還算是講義氣的，韋澤脫離太平天國自然是為了自保，但是韋澤至少給了洪秀全他們極大機會。如果洪秀全當時把楊秀清東王府被殺部眾的親屬都讓韋澤帶走的話，本身也參與到事情只中的石達開就沒有攻擊洪秀全的藉口了。而且殺了東王，韋澤主動跑路，地方上對洪秀全的實力自然會產生極大的疑惑。會認為洪秀全擁有極強的能力。如果那時候洪秀全讓張應宸突然抓捕北王韋昌輝，並且對局面巧加利用的話，想來事情早就平息了。
然而等洪秀全理解到這點之後，事情完全超出了他的控制範圍。韋澤雖然這幾年中功勳卓著，名聲極大。不過他畢竟是齊王，資歷上遠遠比不上永安諸王。當韋澤背後的大靠山東王楊秀清完蛋之後，韋澤的影響力，號召力也根本達不到楊秀清的程度。
翼王石達開就完全不同，他永安諸王的資歷自然是僅次於楊秀清。楊秀清在世的時候，石達開還與楊秀清一起負責中央營運，號召力與影響力極大。很快，地方上對洪秀全完全失望的實力派們紛紛上表，要求翼王石達開主持中央事務，並且負責處理東王楊秀清被殺一事。
雖然晚了一點，洪秀全依舊抓捕了北王韋昌輝，並且重新整頓天京城的軍隊。在韋澤跑路之後，他讓自己的兩個族弟掌握了天京城的兵權，讓張應宸帶兵守住韋澤跑路之後變得空虛的常州鎮江一線。
然而石達開畢竟是老謀深算，陰險狡詐。他並沒有傻等在安慶，而是在西征軍中豫王胡以晃病死，冬官正丞相羅大綱跑去投奔韋澤的機會，回到了太平天國的西征軍中掌握了兵權。面對江西湘軍咄咄逼人的態勢，石達開宣佈自己要打擊湘軍曾妖頭，拱衛太平天國的安全。帶著西征軍進入江西，牢牢的控制了兵權。
面對石達開咄咄逼人的態度，洪秀全經過反覆思考，最終殺了韋昌輝，把韋昌輝的首級送去石達開的軍營中。然而，石達開繼續提出了要求，在假惺惺的要求重點保護北王韋昌輝的親族之後，又提出要殺了燕王秦日綱與佐天候陳承瑢。秦日綱與陳承瑢並非是北王韋昌輝的人，而是天王洪秀全的干將。洪秀全哪裡肯就此屈服。幸好張應宸頗為能幹，帶領了五千部隊抵擋住了直逼常州，並且開始重建江南大營的清軍張國樑。
有了喘息之機的洪秀全把主意打到了韋澤頭上，如果能夠把韋澤請回天京城，翼王石達開在太平天國獨大的局面就會被徹底改變。到了現在，洪秀全看得很清楚，韋澤與石達開根本不是一路人。雙方從一開始就沒有勾結，之後更沒有合流的意思。韋澤實力強悍，在石達開之上，正好是用來平衡石達開的不二人選。洪秀全這才給韋澤寫詔書，請求韋澤回到天國，並且加封韋澤為六千歲。
不過這樣的美好設想被韋澤的檄文徹底打破，看到韋澤從根子上否定了太平天國的這套神權體系之後，洪秀全就明白了，韋澤不僅與石達開不是一路人，更是與他洪秀全不是一路人。
怒火中燒的憤恨了好一陣子，洪秀全終於暫時平靜下來。能夠鬥倒楊秀清，洪秀全也絕非無能之輩。他或許不如楊秀清那般精通軍事，他或許不如楊秀清那般精通行政，可洪秀全在政治上絕非外行。甚至可以稱為高手。
先命人重寫了請韋澤回來的詔書，洪秀全又發詔書到各地，宣佈了他正式請韋澤回來的行動。韋澤的態度是一碼事，洪秀全的態度是另外一碼事。哪怕是明知道無法叫回韋澤，洪秀全也得證明他自己是竭盡全力了。
做完這件事，洪秀全向在安徽的北伐三丞相以及在揚州的曾立昌，告知他們洪秀全準備重建五軍主將制度。而這四個人將是新的五軍主將。林鳳祥、李開芳乃是西王蕭朝貴的舊部，而且林鳳祥與李開芳是金田老