初見大股部隊從南京出發西向，在城外覬覦的清軍將領以為是太平軍想拋棄南京外竄。欽差大臣向榮尤覺高興，以為自己可以乘機&ldo;克復&rdo;南京。
等到太平軍水軍出現在湖口，清朝官員才覺察事情的危險。他們知道南昌危急，急忙碰頭商量對策。正好，以湖北按察使身份的江忠源正率千餘&ldo;楚勇&rdo;（皆是湖南人，當時&ldo;湘軍&rdo;剛剛由曾國藩興辦）往&ldo;江南大營&rdo;去報到。他途經九江時，收到江西巡撫張芾的告急文書，立刻星夜兼程趕往南昌，並在6月23日進入城裡，僅比太平軍早到一天。
有了江忠源這位經驗老到的人坐陣，南昌城內人心稍安。
江忠源是湖南人，舉人出身，熟悉兵法，能幹大事。金田事起，當時在廣西的&ldo;欽差大臣&rdo;賽尚阿就寫信調他入援，江忠源立刻率幾百個湖南子弟前往參戰，可以說是最早與太平軍交手的湖南籍士兵。馮雲山之死，長沙城之全，都與江忠源有關，可以說他是清政府鼎鼎功臣。
剛入南昌，江忠源審時度勢，即命軍士燒毀一切接近南昌城牆的民居，以免使得太平軍藉此為巢穴，盤踞登城。
大火盛燎之下，滕王閣也成為一片灰燼。（所以今天的滕王閣是&ldo;假文物&rdo;）由於各地兵馬紛紛被急調入南昌，加上原有的萬把號人，至八月間，清軍在南昌已有近兩萬人的守衛力量。
江忠源雖為文人出身，但魄力非常，他嚴刑峻法，約束軍隊，只要軍士不賣力，連滿人小頭目他說殺就殺，使得南昌城內守軍的軍紀為之一變。
6月24日，太平軍甫至南昌，在派小股部隊四出搶糧外，主力部隊立刻開始攻城。
多虧江忠源有先見之明，燒毀與城牆相鄰的房屋，一來太平軍無所棲身，二來他們又沒了挖地道所用的掩體。
但是，章江門外的文孝廟還是為太平軍所據，他們憑牆為壘，向城內清軍猛烈開火，打死不少人，最危險一次，差點把清朝巡撫張芾也打死。
攻城不果，太平軍只能仍舊依靠挖地道炸城牆的老辦法。但是，由於鄰城的地方沒有遮蔽，太平軍只能多費氣力，在更遠處挖掘，耗子一樣掏掘寸進，一點一點逼近城牆根兒。
江忠源讀過不少明朝大將戚繼光的兵書，此刻派上大用場。他教會官軍用&ldo;甕聽法&rdo;鑒查，即在城內緊靠城牆處埋設大甕，派人靜坐其中，伺聽地下的動靜。如果發現有掘土之聲，立刻由內往下挖。挖通後，清軍把熱桐油灌入，燙死不少太平軍的&ldo;工兵&rdo;。同時，清軍在南昌城外挖掘不少明濠，內灌入水，如此一來，太平軍許多地道剛挖至清軍處就被水淹衝垮掉。
由於基礎工作做得好，南昌城外居民偏向政府軍。所以，太平軍多次偷埋炸藥，均被人偷偷告知清軍，一一起獲。
楚勇膽量過人。在江忠源激勵下，穩守南昌之餘，百長李光寬率數百人從永和門出城，主動進攻太平軍。雙方血戰，你爭我殺，數千太平軍抵拒這些湖南漢子都感吃力。但李光寬立功心切，太過深入，被太平軍亂槍轟斃。雖然清軍失卻一勇將，但楚勇以幾百當數千的戰績，極大鼓舞了守城軍民的信心。
惡戰之中，你來我往，太平軍三次用炸藥炸塌過德勝門城垣，雙方拼死爭鬥，屍如山積，但最終守方獲勝，太平軍無法克城。
江忠源終日立於第一線指揮作戰，並手刃過數十太平軍攻城戰士，因此守軍勇氣百倍。
圍攻93天，傷亡數千人，太平軍仍舊無法攻克南昌堅城。氣怒之下，由於實現不了攻下南昌後由贛西直插入湘的軍事計劃，楊秀清只得下令撤軍，並把主將賴漢英革職問罪，貶入刪書局去做&l