在打敗使徒的歡呼聲中，大雄、哆啦A夢、胖虎和靜香操控著EVA機體緩緩返回NERV總部。
他們的臉上雖帶著疲憊，但更多的是勝利後的喜悅與自豪。
一回到總部，工作人員們便忙碌起來，對EVA機體進行檢查和維護，而大雄他們則被帶到了休息區。
“哇，剛才那場戰鬥真是太激烈了，我現在還心跳得厲害呢！”大雄一邊擦著額頭上的汗水，一邊興奮地說道。
“是啊，不過我們贏了，哈哈，那使徒也沒那麼難對付嘛！”胖虎拍著胸脯，滿臉得意地說。
靜香白了胖虎一眼，笑著說：“胖虎，你可別得意忘形了，要不是大家一起努力，還有哆啦A夢的那些道具幫忙，哪有那麼容易打敗它呀。”
哆啦A夢也笑著點點頭說：“靜香說得對，這次是大家團結協作才取得了勝利，不過我們也不能掉以輕心，說不定以後還會遇到更強大的使徒呢。”
就在這時，綾波麗走了過來，她看著眾人，眼中帶著一絲欣慰，說道：“你們這次表現得很不錯，尤其是第一次真正參與戰鬥，能有這樣的發揮已經很難得了。不過，接下來還有很多事情要做，你們先好好休息一下吧。”
“謝謝綾波麗姐姐，我們知道啦！”大雄笑著回應道。
眾人在休息區稍作休息後，便被召集到了會議室。碇司令坐在會議桌的首位，表情依舊嚴肅，他掃視了一圈眾人，然後緩緩開口說道：“這次雖然成功擊退了使徒，但我們也不能忽視一些問題。
首先，大雄、哆啦A夢、胖虎和靜香你們幾個，雖然在戰鬥中發揮了作用，但你們的駕駛技術還有待提高，接下來需要進行更加系統的訓練。”
大雄他們紛紛點頭，表示明白。
碇司令接著說：“另外，這次使徒的出現似乎比以往更加突然，而且它的進化能力也讓我們有些措手不及。我們必須加強對使徒的研究，搞清楚它們的進化規律以及是否還有其他隱藏的能力。”
加持良治在一旁補充道：“司令說得對，我覺得我們還需要對周邊地區進行更嚴密的監測，以便能更早地發現使徒的蹤跡，做好應對準備。”
會議結束後，大雄他們便開始了緊張的訓練生活。每天都要在模擬駕駛艙裡進行各種訓練，從基礎的操作到應對各種複雜情況的模擬戰鬥，一刻也不得閒。
“哎呀，這訓練也太辛苦了，我感覺自己都快散架了！”胖虎在一次訓練結束後，累得癱倒在地上，抱怨道。
“胖虎，堅持住呀，只有訓練好了，下次遇到使徒我們才能更有把握戰勝它們呢。”靜香一邊擦著汗水，一邊鼓勵著胖虎。
大雄也點點頭說：“嗯，我也覺得好累，但是一想到如果不努力訓練，可能就保護不了大家和這個城市了，我就又有動力了。”
哆啦A夢從四次元口袋裡掏出幾個按摩球，遞給大家說：“來，用這個按摩一下吧，會舒服點的。”
在大家努力訓練的同時，NERV總部的科研人員們也在緊鑼密鼓地對使徒進行研究。
他們收集了上次使徒戰鬥後殘留的細胞樣本等資料，試圖從中找出使徒進化的秘密。
一天，大雄他們正在訓練時，突然聽到總部內響起了警報聲。
“怎麼又響警報了？難道又有使徒來了？”大雄驚訝地說道，心中湧起一股不安。
眾人立刻停下訓練，朝著指揮室跑去。
一進指揮室，就看到大螢幕上顯示出了城市的某個區域出現了異常能量波動的畫面。
碇司令皺著眉頭，嚴肅地說：“看樣子又有情況了，駕駛員們，準備出擊！這次可能又是一個棘手的敵人，大家要小心！”
大雄、哆啦A夢、胖虎和