在社會價值方面有著重要的作用。在古代，閩南地區自然災害頻繁，社會發展面臨諸多挑戰。清水祖師信仰為民眾提供了一種精神寄託和心理安慰，讓人們在面對困難時能夠保持積極的心態。當遇到大旱、洪水等自然災害時，民眾聚集在祖師廟前祈禱，這種集體的信仰行為在一定程度上緩解了社會的恐慌情緒，增強了社會的凝聚力。而且，清水祖師廟會等活動促進了不同地區、不同階層的人們之間的交流和互動。在廟會期間，無論是富人還是窮人，都共同參與到慶祝活動中，這種跨階層的交流有助於打破社會隔閡，促進社會和諧。
在現代社會，清水祖師信仰依然具有重要的價值。從文化價值來看，它是閩南傳統文化的重要組成部分，承載著豐富的歷史、民俗、宗教等文化內涵。清水祖師廟的建築藝術、民俗活動中的表演藝術、傳說故事等都是閩南文化的瑰寶。透過對這些文化元素的保護和傳承，可以促進閩南文化的多樣性發展，讓後人能夠了解和感受閩南古代文化的魅力。例如，可以利用清水祖師廟發展文化旅遊，吸引國內外遊客前來參觀，讓更多的人瞭解閩南的歷史文化和民俗風情，同時也能帶動當地經濟的發展。
從社會價值來看，清水祖師信仰依然在凝聚人心、促進社會和諧方面發揮作用。廟會等活動仍然是當地民眾社交和娛樂的重要方式之一，豐富了人們的精神生活。同時，清水祖師信仰所倡導的慈悲、善良、互助等價值觀在現代社會依然具有積極的意義，它可以引導人們樹立正確的道德觀念，促進社會文明的進步。在兩岸關係中，清水祖師信仰也是連線兩岸同胞的重要精神紐帶。兩岸同根同源，清水祖師信仰在臺灣有著廣泛的信眾，透過兩岸的宗教文化交流活動，如聯合祭祀、學術研討等，可以增進兩岸同胞的相互瞭解和感情，為兩岸關係的和平發展創造有利條件。
在海外，清水祖師信仰隨著閩南華人的傳播，成為了中華文化在海外的一張名片。東南亞等地的清水祖師廟宇成為當地華人傳承中華文化的重要據點，讓海外華人在異國他鄉依然能夠保持對家鄉文化的認同和歸屬感。同時，也讓當地其他民族的人們瞭解到中華文化的博大精深，促進了中外文化的交流與融合。
清水祖師信仰在藝術領域的影響也不可忽視。在繪畫方面，除了廟宇內的壁畫，還有大量民間繪畫作品以清水祖師為主題。這些繪畫風格多樣，有的是傳統工筆畫，線條細膩，色彩鮮豔，將清水祖師的形象和事蹟描繪得栩栩如生。比如描繪清水祖師在山間採藥、為百姓治病的場景，人物的表情、動作以及周圍的環境都刻畫得十分精細。還有些是寫意畫，畫家透過簡潔而富有表現力的筆觸，傳達出清水祖師的神韻和氣質，體現出一種超脫塵世的神聖感。這些繪畫作品不僅在民間流傳，有的還被收藏在博物館或藝術機構中，成為研究閩南民間藝術和清水祖師信仰的珍貴資料。
在雕塑藝術領域，清水祖師的神像堪稱經典之作。除了廟宇中的大型神像外，還有許多小型的清水祖師雕塑作品，材質包括木雕、石雕、銅雕等。木雕的清水祖師神像往往選用質地優良的木材，如樟木等，木雕藝人運用浮雕、透雕等多種技法，使神像的層次感更加豐富。例如，在一些木雕作品中，清水祖師袈裟上的紋理透過浮雕技法呈現出立體效果，手中的法器則採用透雕工藝，顯得精緻剔透。石雕作品更注重表現神像的莊重和沉穩，石材的質感賦予了清水祖師一種永恆的威嚴。銅雕作品在造型上則更加多樣化，有的呈現出古樸的風格，有的則展現出華麗的色彩，透過鑄造工藝，清水祖師的形象更加生動飽滿。這些雕塑作品不僅是藝術精品，也是清水祖師信仰在物質層面的重要體現，它們被供奉在廟宇中、放置在家中神龕上或者作為收藏品，承載著人們對清水祖師的崇敬之情。
在戲曲藝術方面，以