不過，費爾南德斯的理論並未得到廣泛認可。許多科學家認為，這些生物更可能是目擊者由於長時間暴露在黑暗環境中，產生的視覺錯覺或心理壓力所致。對此，費爾南德斯表示反駁，他堅稱根據多個獨立目擊者的描述，這種生物的存在可能性不容忽視。
同年，西班牙《科學日報》也對這一現象進行了報道，並試圖透過資料分析尋找真相。他們統計了所有目擊事件的發生地點和時間，發現絕大多數目擊報告都集中在地鐵系統的幾個特定區域，如Sol站和Lavapiés站附近的隧道。這些區域通常是老舊的地下隧道，建造於20世紀初期，維護條件較差，光線不足，的確容易引發各種奇異的現象。
隨著目擊事件的持續發酵，神秘動物學家——卡洛斯·蒙特羅開始對這一現象進行深入研究。蒙特羅是西班牙神秘動物學界的知名人物，他曾參與多起歐洲範圍內的未解生物調查。他在《馬德里地下生物調查報告》中指出，馬德里的地鐵系統本身就是一個複雜的生態環境，有可能存在某些未被發現的物種在其中棲息。他還特別提到了一些目擊者所描述的生物特徵，如紅色的眼睛和迅速消失的能力，這些特徵與某些穴居生物的習性不謀而合。
蒙特羅還引述了一個案例：1991年，一名攝影師——路易斯·加西亞聲稱自己在Sol站附近的隧道中拍攝到了一張模糊的生物影像。雖然照片因過於模糊無法作為明確證據，但蒙特羅堅信這是一次重要的發現。他表示，這種神秘生物可能是某種尚未被確認的地下物種，甚至可能是人類活動影響下產生的變異體。
到了90年代中期，目擊事件仍在繼續，但西班牙政府和馬德里地鐵公司對此事的回應顯得相當低調。1995年，地鐵公司發言人發表宣告，否認有任何關於地下生物的確鑿證據，並將所有目擊事件歸咎於“目擊者的想象力”。然而，一些地鐵工作人員卻透露，內部調查確實存在，只不過相關的報告從未公開發表。這讓一些陰謀論者猜測，是否有某些高層試圖掩蓋真相。
1998年，《馬德里紀實報》的一篇報道進一步加深了這一懷疑。該文章採訪了一位不願透露姓名的地鐵內部訊息人士，據其透露，地鐵公司曾多次收到員工和乘客的目擊報告，但所有涉及“怪物”的報告都被歸檔，並不對外公佈。這一訊息立即引發了公眾的強烈關注，但地鐵公司再次以“謠言”為由，否認了這篇報道的真實性。
進入21世紀後，關於馬德里地下生物的目擊事件依然沒有停止。2005年，一位地鐵乘客在深夜末班車之後聲稱看見了一隻“影子”在隧道中移動。2009年，一名夜班清潔工人在工作時感受到一種“被注視”的感覺，隨後發現了一雙紅色的眼睛從隧道深處注視著她。這些事件雖然沒有留下物理證據，但依然讓這個謎團保持著它的神秘色彩。
在2010年左右，地鐵系統內部的討論再一次引發了公眾的關注。據《馬德里之聲》報道，多名地鐵工作人員匿名透露，他們曾在夜班期間目擊到不明生物的蹤影。一位地鐵司機聲稱，某次夜間駕駛空車回到維修站時，在車燈照到隧道一側的牆壁時，看到了一雙紅色的眼睛。司機認為那是某種動物，或許是一隻變異的大型貓科動物，但令人費解的是，它沒有任何的躲閃或驚慌，而是靜靜地盯著他，直到列車駛近。
另一位目擊者是地鐵站的一名保安人員，他聲稱自己在深夜巡邏時，聽到隧道深處傳來奇怪的聲音。他走近探查時，看到一個高大模糊的身影一閃而過，留下了若隱若現的腳印。保安人員立刻報告給了上級，但卻沒有收到任何回覆。之後他便意識到，地鐵系統似乎對這類事件採取了“冷處理”的態度，鼓勵員工保持沉默。
2012年，馬德里大學的生物學研究團隊釋出了一份研