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在以往的科舉考試，八股文佔據著極其重要的地位，除殿試而外，府、省、京城三級由小考到中進士考試都是以八股文為主。因為首場作八股文，試官評閱取中取不中，全看首場，首場不入試官眼。二場、三場所寫的論、判、案等看也不看了。所以八股文是惟一的考場文字，能否考中，全看學子寫八股文的功力如何了。
經過朱由校的改革，八股文在科考中的地位從一家獨大轉變成了四分之一，朱由校相信經過十數年之後，再談廢除八股文，反對的聲音會小許多。其實在中國的封建歷史上，曾有數次廢除科考或者廢除科考的計劃。
雖然朱由校做出了巨大的讓步，但帝國上下依然有許多反對的聲音。科舉考試內容的變化，讓帝國的學子們非常困惑，也非常反感。
“陛下，單論考歷史，帝國有上千年的歷史，這當如何出題？”
“此事朕已經考慮好了，可由禮部編寫教材，題目從禮部編寫的教材中選取，題目可分為填空題和論述題，朕簡單地做了一份試題，可供禮部拿來參考。”朱由校早就做好準備了。
“陛下，那時政該考哪些內容呢？”
“時政考題，考的是帝國以及國外五到十年之內發生的政治大事，是概括性比較強的、從大局出發的事件，當然禮部也可編寫相應的教材。題目也可分為填空題和論述題，例如荷蘭十年前發生的鬱金香泡沫，此事不但影響西洋，而且還影響了帝國，這樣的事件便可出題考試。其實《帝國報》上的時政文章，便是最好的時政題。朕不需要‘兩耳不聞窗外事，一心只讀聖賢書’的人，這樣的人一旦當政只會誤國誤民。”朱由校解釋道。
“臣明白了。”
“至於數學該考哪些內容？這就不需要朕來明說了吧。”
……
第二個最大的變化的就是以後所有的官員都要從胥吏做起，而且必須擔任胥吏一年以上才可提拔。以前朱由校只是給了胥吏一個提升的通道，現在朱由校要求所有的官員都必須從胥吏做起，從另外一個方面來說，意味著胥吏地位的提高。
“陛下，以後的官員都必須從胥吏做起，這對於寒窗苦讀計程車子來說，是不是太不公平了？”孫元化問道。
“大明自開國之初，便規定國子監生都需在各部歷事三個月，歷事期間所做之事便與胥吏並無差別。只不過與胥吏不同的地方便是，他們有提升的機會，而胥吏一輩子都是胥吏，這對於胥吏來說，難道不是不公平嗎？而事實上，在帝國啟用胥吏之後，朝廷發現胥吏在治理地方的能力上比起這些國子監生有過之而無不及。朕認為胥吏強，便強在他們長期在基層，對於基層的情況瞭如指掌，這才使得他們在治理地方上強於所謂的監生。”朱由校解釋道。
其實王安石變法時，王安石主張，即將出任公職的人都應當先擔任胥吏的職務，讓他們預先學習將來自己所要指導和監督的工作。其次，他主張提高胥吏和下級僚屬的地位，以消弭或縮短他們被隔絕於文官制度之外所造成的差距，希望將他們納入儒家倫理和社會規範的約束之下，並啟發他們忠誠奉獻的精神。
朱由校便是借鑑了王安石變法中的一些主張。
第三點不同是，朱由校廢除了童生試，鄉試，自從帝國推行義務教育之後，童生試已經失去了原來的作用，在鄉學畢業的學生都可自動可獲得畢業證，畢業證的作用就已經等同於考過童生試了。
縣學不是義務教育，必須參加地方上考試，考試合格者才能進入縣學，縣學的考試已經起到了鄉試的作用，取得縣學的畢業證，便是等同於透過了鄉試。
朱由校暫時只廢除了童生試和鄉試，卻保留了會試和殿試。朱由校知道現在在