埃。
“什麼？”
“那些遺蹟，還有人類毀滅的原因！”
魯魯修的目光在天空和大地之間來回打量著，目光越來越慎重。他似乎感覺到了一無比強大的意志，正從四面八方，天空和大地之間，窺視著自己，那裡面，蘊含著一股強烈的惡意。
而空氣中，同樣也有一股不知名的聲音，在呼喚著他，指引著他，似乎是想告訴他什麼。
第二章 人類之王的救贖
世界上唯一剩下的一男一女兩個人類，開始了探尋人類毀滅，和地球未來的旅途。在那股神秘的聲音的指引下，魯魯修和CC的腳印踏遍了已經被毀滅的世界的每一個角落，將曾經查魯魯沒有找到的遺蹟，全部找了出來。
亞洲三座，歐洲三座，美洲三座，非洲一座，澳大利亞一座！
總共十一做遺蹟神殿，十一扇通往C世界的大門。
但是，魯魯修和CC找到的時候，這些門，已經打不開了。即使結合他們兩人CODE印記，加上那足以移山倒海的能力，也無法驅動這扇大門分毫。但是，魯魯修和CC並非一無所獲，結合從十二座遺蹟得到的資訊，魯魯修推測，還有第十二座神殿，也是所有遺蹟的中心。
它的位置，坐落在世界的中心，傳說中的上古文明，亞特蘭蒂斯文明淹沒的太平洋底。
以非人之軀，達成奇蹟的兩人，花費了百年的世界，利用逐漸熟悉的力量，將整個太平洋中心的大海溝從中分開，終於發現了地十二座神殿。
亞特蘭蒂斯文明，曾經的國都，也是最後一處遺蹟！
踏入這座淹沒在海底上萬年的皇城，魯魯修和CC終於抵達了位於古城最中心的總神殿。在這裡，魯魯修和CC終於從遺留在神殿裡那銘刻在牆壁上的壁畫，推知了發生在數萬年前，亞特蘭蒂斯文明，一夜之間消失的謎底。還有魯魯修和CC的CODE印記，以及GEASS，C世界，所有的一切，都在此刻，真相大白。
不錯，無論是C世界，還是CODE，以及這些遺蹟，都是數萬年前，亞特蘭蒂斯文明留下來的遺物。而直到這個時候，魯魯修和CC才最終得知了，人類戰爭，以及毀滅的真相。
毀滅人類的，並不是人類自己，而是……地球，所有生物的母親，生命的起源！
她的名字，叫蓋亞！
數百萬年輕，毀滅橫行地球兩億年的恐龍一族，然後又將極度發到的高等人類文明亞特蘭蒂斯一舉埋進太平洋的，正是地球的抑制力的象徵，蓋亞！
蓋亞不光是抑制力，沒錯，因為在生命出現之前蓋亞就存在。那時的它沒有要抑制的物件，它的存在是在生命之後，為了保障生命中某一類的生存而出現的，存在的理由就是為了抑制所有能威脅靈長類全體存在的人、事、物所以它除了抑制力之外什麼都不是。
數百萬年前，恐龍一族膨脹到極限，已經威脅到了地球上所有的生命。所以，蓋亞召來了一顆隕石，將所有的恐龍滅絕了。
第一次，蓋亞慢慢擁有了自己的意識，也明白了自己的使命。
幾萬年前，靈長類的一隻族群，三眼族人逐漸擁有了自己的文明，他們自稱亞特蘭蒂斯人，他們的文明，就叫做亞特蘭蒂斯文明。亞特蘭蒂斯人天生擁有強大的力量，能夠行使精神力做到各種匪夷所思的事情。隨著科技的發展，他們漸漸的將研究的物件轉變到自己的身體。
身體的進化，精神的力量，以及最最神秘的靈魂。
這種行為，觸犯到了生命的禁忌，引起了地球蓋亞意識的注意。但是因為亞特蘭蒂斯人的研究並沒有威脅到其他生命的存在，而且也沒有造成太大的破壞，所以蓋亞意識只是在暗中監視著亞特蘭蒂斯人的一舉一動，並沒有干涉他們的行為。