擊性魔法，如火焰風暴魔法、閃電鏈魔法等，試圖突破神秘艦隊的能量護盾。混沌宇宙的修士們則在戰艦的靈能核心區域，加大靈能輸出，為戰艦的武器系統和防禦系統提供更強大的靈能支援，同時施展靈能護盾修復術，及時修復被敵人攻擊損壞的靈能護盾。
在激烈的戰鬥中，先遣隊逐漸發現了神秘艦隊的一些弱點。他們發現神秘艦隊的能量護盾在應對多頻率、高強度的攻擊時，會出現短暫的能量波動和防禦漏洞。星耀宇宙的科學家們迅速調整戰艦的武器發射頻率和能量強度，集中火力攻擊這些漏洞。幻魔宇宙的魔法師們也配合著施展出魔法力量聚焦術，將魔法攻擊的力量集中在敵人護盾的薄弱點上。混沌宇宙的修士們則利用靈能感知，提前預測敵人護盾的能量波動週期，為攻擊提供精準的時機把握。
經過一番艱苦的戰鬥，先遣隊成功地擊退了神秘艦隊的攻擊，但也遭受了一定的損失。先遣隊帶著戰鬥中獲取的資訊返回宇宙聯合艦隊總部，這些資訊對於制定針對神秘艦隊的整體戰略具有重要意義。
宇宙聯合艦隊總部根據先遣隊的彙報，重新調整了作戰計劃。他們決定集中各文明的優勢力量，打造一支超級旗艦戰隊，專門應對神秘艦隊的威脅。星耀宇宙負責為超級旗艦提供最先進的科技裝備和武器系統，如量子能量護盾、超光速引擎以及引力波武器等；幻魔宇宙負責為超級旗艦施加強大的魔法防護和攻擊魔法陣，如永恆魔法護盾、末日審判魔法陣等；混沌宇宙負責為超級旗艦構建穩定的靈能核心和靈能共鳴系統，如混沌靈能熔爐、宇宙靈能共鳴塔等。
在超級旗艦戰隊的籌備過程中，對神秘球體的研究也進入了關鍵階段。星耀宇宙的科學家們在對高維空間通道的研究中，發現了一種可以暫時封印通道的方法，但這種方法需要消耗巨大的能量，並且只能維持較短的時間。幻魔宇宙的魔法師們在靈魂淨化魔法的研究上取得了重大突破，他們成功地提煉出了一種可以淨化球體靈魂中邪惡力量的魔法藥劑，但這種藥劑需要在球體靈魂的核心區域才能發揮作用，而要進入核心區域，需要突破球體強大的靈魂防禦力量。混沌宇宙的修士們在引導球體靈能與宇宙自然靈能融合的實驗中，找到了一種相對穩定的融合模式，但要將這種模式應用到實際中，還需要解決球體靈能的大規模傳輸和控制問題。
就在各文明為解決這些難題而努力奮鬥的時候，宇宙中又出現了新的危機。一些原本被認為已經被控制住的神秘事件區域，突然再次爆發大規模的能量混亂，而且這次的混亂程度遠超以往。這些區域的時空扭曲變得更加劇烈，許多星球被捲入其中，面臨著毀滅的危險。宇宙聯合艦隊不得不分出一部分力量，前往這些區域進行緊急救援和危機處理。
星耀宇宙的救援艦隊利用空間摺疊技術，迅速趕到受災區域。他們在受災區域周圍佈置了能量穩定裝置，試圖阻止時空扭曲的進一步擴大。然而，由於能量混亂的強度太大，能量穩定裝置很快就被過載損壞。科學家們迅速對裝置進行調整和升級，增加了能量吸收和轉換模組，提高了裝置的穩定性和耐受性。幻魔宇宙的魔法師們在救援艦隊中施展大規模的魔法穩定術，他們在受災區域的上空繪製出巨大的魔法符文陣，透過符文陣將魔法力量注入到混亂的能量場中，試圖平復能量的波動。但魔法穩定術的效果受到了一種未知的黑暗力量的干擾，魔法師們不得不與這種黑暗力量展開一場魔法拔河比賽。混沌宇宙的修士們則在受災區域的星球上，利用靈能修復術，拯救那些被靈能汙染的生命和生態系統。他們在星球的靈能核心區域佈置靈能淨化陣，將被汙染的靈能逐步淨化，然後引導宇宙自然靈能重新注入星球，恢復其靈能生機。
在各文明齊心協力應對新危機的過程中，他們逐漸發現，這些新危機的背後似乎隱藏