在邊境抵抗華軍強大裝甲攻勢的只有隸屬於蘇聯內務人民委員部的各邊防總隊和少量野戰軍。這些邊防部隊配備了大量的衝鋒槍和機槍。內務人民委員部計程車兵都是極為頑強的，他們憑藉堅固的工事。不僅以疾風驟雨般猛烈的射擊給進攻的華軍造成了重大的殺傷，而且往往打到最後一個人。象蘇軍第90邊防總隊第13號哨所從戰爭第一天一直打到4月12日，堅持戰鬥達11天之久。在戰鬥的最後一天，該哨所殘餘人員在被華軍戰鬥工兵用炸藥爆破的前一刻，還在已化為廢墟的哨所內拼死抵抗。而在第10集團軍步兵第8師防禦地區，工兵第57營在師主力趕到前阻止華軍的攻勢直到中午12時。但這些兵力薄弱的部隊並不能擋住華軍的去路。華軍將他們交給後續的步兵部隊去解決，裝甲縱隊則繞開其堅守的哨所和工事，向蘇聯領土縱深快速推進。在中國坦克開進的方向上，那些本來應在邊境工事中抗擊華軍的蘇聯步兵師，此時還在離國境8至20公里的地方。他們大多無法接到上級命令。因為在被中國人收買的當地民族主義者的破壞下，蘇軍在許多地段的有線通訊系統幾乎癱瘓。在西伯利亞特別軍區，通訊在中國人越過國境的4時30分便被破壞；而在秋明特別軍區，由於無線電斷斷續續，直到上午9時軍區才對形勢有了一個粗略的瞭解。在這危急關頭。面臨華軍強大突擊的蘇聯指揮官們只能冒險開啟戰前發給的裝著國境防禦計劃的保密密封袋（在蘇聯體制下這是很危險的），按上面規定的地點和路線（除此之外他們幾乎對周邊的敵我態勢一無所知）。在只有少量彈藥的情況下（蘇軍的彈藥庫是由內務人民委員會管理的，在當時的緊急情況下，各部隊往往來不及從那裡領取到彈藥），將屬下那些對突然降臨的戰爭感到茫然的部隊匆匆忙忙的帶出兵營，在華軍不斷的空襲和炮擊下，冒著巨大的傷亡集結開進。在這一過程中，士兵們已被不斷呼嘯而至的中國飛機，和不知來自何方的猛烈炮火（華軍偵察機不斷矯正著炮兵的射擊）打得精神沮喪，當他們在行進間突然遇上由大量摩托車，越野卡車，半履帶裝甲車伴隨的華軍坦克契形縱隊時，根本無法進行有效的抵抗，有些部隊甚至因此而潰散。紅軍第4集團軍第一號戰報這樣描繪當時的情景：在戰鬥中，“往往要由從集團軍司令員起的各兵團指揮官來制止凌亂後撤的分隊。有時是整支部隊。讓他們掉頭再上前線，但是這些措施，有時甚至是使用武器，並不能獲得應有的效果”。對於蘇聯邊境所發生的事態，新任的中國陸軍總參謀長蔣百里上將在當天日記中的記述倒顯得更為冷靜，客觀：“敵人（蘇軍）被我軍的進攻打的措手不及，他們的部隊沒有做出防禦戰鬥部署，邊境地區的部隊在各自的防區分得很散，國境線本身絕大部分地段的警戒是薄弱的。”…；
在中國飛機剛剛攻入蘇聯不久，遭到攻擊的東部各軍區便向莫斯科的國防人民委員部發出報告。當總參謀長朱可夫按國防人民委員鐵木辛哥的命令。將這些關於華軍對西西伯利亞各城市和地區進行空襲的訊息用電話報知斯大林後，這位蘇聯“當家的”陷入巨大的震驚，以至久久不能做出回答。當他回過神後，便用嘶啞的聲音讓朱可夫、鐵木辛哥和全體政治局委員來他的辦公室（也有史料認為這些人很早就集中在了斯大林辦公室）。4時30分。當人都到齊之後，看上去非常茫然的斯大林打破了沉默。
“你們有什麼建議？”斯大林向軍事統帥們問道。
“指示邊防軍全線出擊，遏制住敵人的進攻。”朱可夫馬上表態道。
“不是遏制，而是消滅敵人。”鐵木辛哥元帥則趕緊進一步表態。
由於斯大林同志發話了，鐵木辛哥，朱可夫和政治局委員們馬上變得相當樂觀起來。正是在這種樂觀的氣氛下，鐵木辛哥於7時15分以總軍事委員會的名義發出了第2號