到了第二部，這些仍然有，但劇情、剪輯和臺詞等等，對觀眾太不友好了。
《駭客帝國2：重灌上陣》的cea sre影院觀眾現場打分只有「b」，而且大部分影迷提到了一個問題：晦澀難懂！
第一部真的很好看，炫酷的動作，緊湊的劇情。科技的發展到極致反而給人類帶來無盡的災難，為了使人類擺脫電腦的奴役而奮鬥，很是高大上。
到了第二部簡直就是災難……
面對遠遜於第一部的口碑，很多沃卓斯基兄弟的鐵桿粉絲強調，《駭客帝國2》其實探討的是哲學問題。
《駭客帝國》第一部上映後的哲學思辨，曾經被影評人們盛讚，或許沃卓斯基兄弟受到了影響，在職業影評人的誤導下一頭扎進溝裡，從此再也沒有爬上來。
回歸電影本身，電影終歸是講故事，導演可以使用炫酷的影音，高能的拍攝技巧，讓觀眾在賞心悅目，欲罷不能的過程中聽你講完整個故事。
甚至，對於商業電影來說，像麥可·貝那樣表現形式遠遠超過故事本身，也比神神道道的哲學思辨更有看點。
很多影迷的心中，《駭客帝國》有且只有一部，後兩部就是另外兩個不相干的故事，拖沓冗長，看得人索然無味如同嚼蠟。而且對白半半拉拉含含糊糊，還總讓觀眾費神猜謎。
就電影來說，再複雜的內容都以讓觀眾看得簡單易懂為榮，畢竟講故事，講一半掖一半以搞暈觀眾為目的的手法只是為了掩蓋劇情的蒼白。
由於影片本身對於觀眾太不友好，加上各種負面口碑和首日釋放了不少續集電影的能量，《駭客帝國2》週六票房暴跌，單日跌幅接近百分之二十，只拿到了3031萬美元。
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