發揚光大，可最終結局卻是這般，他十分的不甘心。可再不甘心也沒有辦法，面對四幫八方追殺則來的官軍，他只能跑了。
馬大龍最終還是沒能跑脫，他被兩個家在橫瀝的捕快當場擒住。那兩捕快原是要將馬大龍就地陣法，可聞訊趕到的湯效先卻阻止了他們，命將馬大龍和一眾被俘的教民押進城中大獄。
三天後，齊王駕下快馬傳令，著將馬大龍及被俘教首一律凌遲處死，餘者皆斬首懸於高處示眾。參與暴亂教中之人，一律族滅。
嘉定的教亂從開始到被完全鎮壓，不過四天。可這四天，嘉定百姓付出的代價卻太大了。湯效先初步統計，僅嘉定一縣被發現的屍體就有三萬多，被火燒的無法統計，逃散的也不知多少，可以說是整個江南受災最嚴重的地方是松江，松江最嚴重的地方就是嘉定。
事後，於百恩從各鄉廢墟回來，哭著寫道：“定武二年三月間，殺氣瀰漫天。十餘萬人一朝盡，問誰不心酸。桃含愁兮柳帶煙，萬里黃流寒。闔邑子弟淚潸潸，染成紅杜鵑。清歌一曲信史傳，千秋壽名山。碧血灑地白骨撐天，哭聲達江南。”
找到丁主薄三人的屍體後，湯效先就立即從城中趕到。跪在河灘邊哭泣半天之後，湯效先突然起身，對左右隨從說道：“我為嘉定父母，嘉定子民卻因我而枉死數萬，我萬死也難辭咎，今唯有以死贖罪。”說完，縱身跳進河中。左右連忙跳河相救，經一番掙扎後，湯效先終是被救上岸。此後，他卻再也不發一言，也不飲滴水，不食粒米，竟是要絕食而亡。
數日後，有錦衣內衛前來嘉定縣城，出示駕貼，將湯效先解往南都。知自己被鎖拿後，湯效先卻是肯進食，解官問他為何不絕食到底，他言道：“從前絕食只因父母官，現在卻為罪官，身為罪官，如何能自己絕食，當受國法處置。”
半道，又有松江知府蔡文喚等民被鎖拿同解南都。一月後，蔡文喚因應對教亂不力被齊王怒斥無能典型，梟首示眾；湯效先亦已同樣罪名被革官，刑部擬處斬，臨刑前齊王特下王諭，著將湯效先解往安南，以戴罪之身贖罪。
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松江境內除馬大龍部殺人甚多，另有教民白東干亦是殺人無數。其於起事之前，點火將自家房子和附近教寺引著，聲稱官府要清教，威逼裹挾數百教民和他一同造反。
白東干部無甚目標，三五成群，由小團伙聚成大隊伍。他們一路燒殺搶掠，所經之處，血雨腥風，一片灰煙。聽聞金山衛有不少漢人商販於那聚集，白東干便率部轉往金山。至楊家灘時，附近漢民早就逃光，很多人逃進蘆葦叢生的河灘和海灘避難。有一村莊漢民逃進大金山中一山洞，被白部發現。因洞口在崖上，村民踩梯子進去後，把梯子抽掉，白部土匪上不去，進不了，便拔來乾燥的特蓬，此物有毒，架在洞口下面燒。濃煙上升，鑽進洞口，洞中一片慌亂，有村民暈過去了。
洞中有張姓青年，名全柱，尚未結婚，長得人高馬大，因家境較好，平時東遊西蕩，喜歡幫人打架，又好賭搏，在村民中口碑十分差。不過此人因為沒事喜往大金山上鑽，所以知道山上這洞還有個隱蔽出口。於是他見情況危急，大夥都不能活了，便帶了一把鐮刀，往那隱蔽出口方向爬。
張姓青年另有個賭友叫劉二狗的，悄悄跟在張全柱身後。不過劉二狗卻不知道他後面還有個女人跟著，卻是村中蔣家的媳婦，肚中有七個月的身孕。到了出口處，張全柱才知道身後身人。都是一個村的，又是生死危急時刻，張全柱倒也沒有扔下二人不管。他先爬上去，拉蔣家媳婦上去，叫劉二狗在下面推蔣家媳婦的屁。股。怎奈洞口太小，蔣家媳婦肚子大，怎麼也通不過。無奈，張全柱只能狠心硬拽，結果蔣家媳婦人是被拉上去了，可肚子裡的孩子也掉了。不過也算是將命保住了，要知道