天命十年十月初三日，努爾哈赤下達長諭，指責漢民&ldo;窩藏奸細，接受札付，叛逃不絕&rdo;，歷數鎮江、長山島、川城，耀州、彰義站、鞍山、海州、金州等地漢民武裝反抗事例，宣佈要斬殺叛逃之人。他命令八旗貝勒和總兵官以下備御以上官將，帶領士卒，各去自己轄屬的村莊，&ldo;區別&rdo;漢民，凡系抗金，一律處死。各將遵令，&ldo;分路去，逢村堡，即下馬斬殺&rdo;。
時有遼民幾盡殺光之說。
努爾哈赤還在十月初三的&ldo;汗諭&rdo;中，命將未殺的&ldo;築城納賦&rdo;之&ldo;小人&rdo;（即勞動），全部編隸汗、貝勒的拖克索（莊），每莊十三丁、七牛，耕地百晌，八十晌莊丁&ldo;自身食用&rdo;，二十晌作&ldo;官賦&rdo;。編丁隸莊後，總兵官以下，備御以上，&ldo;每備御各賜一莊&rdo;。這樣一來，原來&ldo;計丁受田&rdo;的漢民，失去了&ldo;民戶&rdo;的身份，淪落為奴隸制農奴性質的&ldo;莊丁&rdo;，被迫繳納數倍於&ldo;計丁授田&rdo;之丁上交的丁賦，人身奴役加重，剝削更為厲害。
遼東地區的大多數漢民（即除去原系阿哈地漢民以外），從&ldo;計丁授田&rdo;的後金國&ldo;民戶&rdo;，下降為繳納高額地租、慘遭莊主壓迫的封建農奴，嚴重地加深了遼民的苦難，農奴制莊園惡性擴充套件，遍佈後金轄區，這是很大的倒退。
努爾哈赤令漢人與女真人合戶，實際上是將滿族旗人分置於漢人各戶之中，滿人奴役漢人，漢族男丁承擔了全部重體力勞動，漢族婦女則成了他們的奴婢。
如此的不平等，加上缺衣少食，就導致了1623年滿、漢之間的一系列衝突。許多漢人故意在食物和飲水中投毒，焚燒房舍，還殺死了一些後金的哨卒。
努爾哈赤對漢人抗暴作出地反應。是進一步種族歧視、種族清洗。
他憤怒地責問八貝勒：&ldo;我等之兵去後。耀州之人即揚言殺我婦孺。其他各地之人亦毒殺我等之諸申。爾等知否？&rdo;
又斥責各旗大臣對漢人過分寬容：
漢官與我等之諸申。因何同等對待？若我等之諸申犯罪。則問其功勞。問其官位。稍有理由。即應赦之。若尼堪犯下死罪。又未盡心效力。復有偷竊之事。則應盡誅其子孫親族。為何僅責打了事？
竊據瀋陽後。滿漢人戶便被指定居住在按種族劃分地區域內。除此之外。努爾哈赤還規定漢人不得持兵器；而女真人則無論是不是八旗兵丁。都要隨身攜帶兵器。
這種旨在阻止漢人反抗地歧視政策。可能正是1625年漢人叛亂地導火索。這年秋。許多滿族兵民被殺。據說還有漢人派人向附近地明軍求援。希望重返明朝。11月。努爾哈赤採取了嚴厲措施。遂令滿族官吏進行徹底調查。清洗各村帶頭鬧事地秀才：
並非我等嘉善拔擢之官員，乃是昔為明國秀才、大臣而今無官，聽信奸細之言，煽動當地村民。凡此等人，皆檢出誅之。
最後又演變成大規的殺富戶。
以上史料主要有兩點，貫穿的是先殺窮戶，凡是家裡沒有五斗米的窮戶一律斬殺，遼東漢人的人口銳減一大半。接著又是殺富戶，凡是富人都有通敵之嫌全部殺，整個遼東已沒有了漢人人煙，這也是遼東地廣人稀地根源。
接下來滿人入關之後，認為遼東是滿洲的龍興之地，不允許任何漢人遷出關，直到1860年，面對沙皇俄國對東北地區領土的蠶食，黑龍江將軍特普欽上疏朝廷，呼籲開禁放墾，鼓勵移民，獲得採納。於是直隸（今河北）、山東等地區無地或少地農民紛紛進入東北