產生了對立。段祺瑞以國務總理的身份掌握著*；馮國璋雖在1916年10月由國會選為副總統，但為了保持自己的實力地位，仍留任江蘇督軍，而不到北京。繼任大總統黎元洪，名為國家元首，但並無實力，一心想利用直皖之間的裂痕，以馮國璋排斥段祺瑞。於是就有了總統府和國務院明爭暗鬥的“府院之爭”。“府院之爭”在“參戰”問題上達到白熱化。
一、獨特的政治統御 參與府院之爭（2）
1914年爆發的第一次世界大戰，幾乎將所有的歐洲國家都捲入戰爭的漩渦，自顧不暇。在遠東可以互相抗衡的只有美國和日本。1917年2月，美國參加世界戰爭，遂促中國加入協約國對德宣戰。始以美元作誘餌，極力慫恿其所支援的黎元洪政治集團和直系馮國璋參戰。隨之日本帝國主義為了擴大其在華權益，也以日元作誘餌，極力慫恿他所支援的皖系軍閥段祺瑞參戰。美國見自己慫恿黎元洪參戰為日本所利用，就轉而唆使黎元洪出面反對段祺瑞提出的“參戰案”。於是“府院之爭”在“參戰”問題上愈演愈烈。先是，4月25日，段祺瑞以國務總理身份召集各省督軍及都統在北京開會，“商討加入協約國對德宣戰問題”，決定參戰。並強令黎元洪在“參戰案”上副署。接著，5月10日，段又在國會審議“參戰案”時，以軍警包圍國會，強迫議員透過。在議員拒絕透過“參戰案”後，黎元洪下令免去段祺瑞的國務總理。段在暫處劣勢的情況下，以天津為基地，另起爐灶，唆使各省督軍提出解散國會、脫離中央。
在以黎段為代表的“府院之爭”中，閻錫山一改袁世凱時期唯唯諾諾的態度，始終表示出支援段祺瑞的立場。
3月5日，閻錫山致電段祺瑞：“辛亥以還，我公以碩望元勳，擔荷天下。逮乎共和再造，手挽狂瀾，身系安危，蒼生託命。此次處理外交，內審國情，外觀大勢，早為當世有識者所共諒。邦基未固，諸待護扶，環顧國人，疇克當此重任。務望我公以國家為重，勉抑淵衷，早循眾請，返駕視事，徐圖挽拯。”
3月6日，閻錫山又以“總理赴京，意欲辭職，現正設法挽留”等因致電黎元洪，指出，“共和再造，邦本未寧，內政外交，諸待處理。總理以碩望元勳，遽爾去職 ，關係之重，無待贅陳。敢懇鈞座本飢溺猶己之心，循宮府一體之義，速挽行旌，徐圖大計。”
4月25日，段祺瑞召集“督軍會議”。已於當月12日應召由併到京的閻錫山，以山西督軍身份參加了會議。會上他與河南督軍趙倜、山東督軍張懷芝、江西督軍李純、湖北督軍王佔元、吉林督軍孟恩遠、直隸督軍曹錕、安徽省長倪嗣沖、察哈爾都統田中玉等及其他各省代表，表示贊成段祺瑞的政策，一致主張對德宣戰。
“督軍會議”之後，閻錫山藉口內蒙不穩，太原連電催返而返回太原，以避免黎元洪方面的糾纏。而在5月18日由北京發出的各省督軍響應段祺瑞號召，要求解散國會的電文之上，仍有他的署名。
5月23日，段祺瑞被黎元洪免除職務後，“安徽省長倪嗣沖，首先宣告與中央脫離關係，奉、黑、直、魯、陝、豫、浙、閩等省，隨即相繼響應。皖、豫、魯各軍北上，奉軍入關。” 在各省督軍紛紛宣佈獨立的聲浪中，閻錫山於6月初奉段的旨意，宣佈山西獨立，脫離北京中央政府。與此同時，為對黎元洪進行武力威脅，遂命第一旅旅長商震率晉中兵隊進駐石家莊，並藉故下令逼迫黎元洪集團委任之山西省長孫發緒離職。
閻錫山在此期間的熱衷表現不能不引起世人的關注。是故，當北