第二條，是按毛人鳳所說的學王佐，假投降，真*，混進革命隊伍做一顆定時炸彈，等待蔣介石捲土重來，再大幹一場。但一想到這一切都是毛人鳳一手造成的，再為毛人鳳送死是萬萬不甘心的；第三條路，是真起義、真投降，號召雲南的特務及其武裝放下武器，交出電臺和檔案，爭取寬大處理。想來想去，終於決定走第三條路。
東方發白，沈醉的心情平靜下來。他在盧漢宣佈起義的通電上籤了字，又以個人名義專門擬就致雲南區所有特務人員的通電，要求：“自即日起停止一切活動，所有武器立即繳出，所有通訊器材不得破壞，遵照呈繳並自動出面辦理登記手續，聽候另派工作，切勿藏匿逃逸，故違自誤，而放棄此唯一自新良機。”
與此同時，沈醉還供出了與張群同機抵達昆明，準備轉機赴臺灣的徐遠舉等西南大特務頭子的下榻之處，盧漢派人將他們一網打盡。
他原以為自己很快會恢復自由，與家人團聚，但是事態的發展出乎意料。就在盧漢宣佈雲南起義的第三天，李彌的第八軍和餘程萬的第二十六軍，並未按起義通電的要求服從盧漢的指揮，反而開始進攻昆明。在不得已的情況下，盧漢釋放了李彌和餘程萬、石補天，希望他們去約束部隊。但這些傢伙回到部隊後，變本加厲地進行反攻；臺灣派來的飛機也轟炸市區，配合行動。盧漢擔心釋放了沈醉等人，萬一與李彌等人一樣翻臉不認賬，將會造成更被動的局面，於是將沈醉等關押在陸軍監獄之中。
1950年3月，人民解放軍進駐昆明，實行軍管。盧漢在辦理移交手續時，將沈醉等人當成要犯，交給了軍管會。同年12月底，沈醉被押解到重慶白公館。
沈醉經過長期的思想和勞動改造，終於脫胎換骨，被人民政府特赦。晚年的沈醉寫下幾百萬字的文史資料和文章，揭露蔣家王朝的罪惡。改革開放以來，為祖國統一貢獻了應有的力量，被特邀為全國政協委員
沈醉住進了曾關押過葉挺將軍的牢房。所長派人去給他開啟腳鐐手銬，押送人員因把鑰匙丟了，急得滿頭大汗。居然要用鋸來鋸。沈醉笑著問：“真的要解掉我的手銬嗎？”
所長說：“當然，之所以給你帶上，是怕你在路上跑掉嘛。”
沈醉走到床邊，從席上折下一根竹篾，輕輕地往鎖孔裡一捅，只聽見“啪嗒”一聲，手銬竟然開了。所長和押送人員都大吃一驚。
沈醉笑了笑：“要跑，還等到今天。”
1960年11月28日，沈醉被最高人民法院宣佈特赦。
不久，在北京中南海西花廳，周恩來、陳毅、羅瑞卿分別接見了特赦的國民黨戰犯。
“你們搞的那一套，從來沒有起過作用。反倒給我當了義務隨從。”周總理風趣地對沈醉說道。在上海、重慶、南京解放之前，沈醉曾親自帶領特務對周總理搞過偵察、跟蹤、監視活動。
沈醉向總理請罪。周總理卻道：“共產黨只有階級仇恨和民族仇恨，從來不計較個人得失。特赦你們，是希望你們今後能好好做人，做一些對人民有益的事情。”
沈醉又問：“我怎麼才能做出對人民有益的事來呢？”
周總理說：“你在軍統那麼多年，跟在戴笠身邊那麼久，你把軍統的種種內幕如實寫出來，不論是你自己幹過的，或是你看到聽到的那些阻礙革命、屠殺革命人士等等見不得人的東西，都寫出來。讓後人知道革命的艱難和反革命的殘暴，使大家懂得革命勝利來之不�易……�”
於是，沈醉所著的《我所知道的戴笠》、《楊虎城將軍被害經過》、《保密局內幕》等十幾部書稿，先後在《文史資料選輯》上刊登，後來香港幾家報紙相繼轉載，一下子激起了臺灣國民黨的惱怒。
起先，毛人鳳以為沈醉在雲南“捨身殉