人口數量下降到20萬人之後，滄瀾人啟動了應急方案，將大部分族人送去休眠，只保留了少部分人，繼續研究延續後代的方法，並維護亞特蘭蒂斯城的正常運轉。每隔12年，他們就喚醒新的一批滄瀾人接班，原來的那批人進入冷凍休眠。此後的一萬多年時光，滄瀾人都是如此度過的。在此期間，他們在延續後代方面的研究，沒有取得任何的進展，卻意外的在生命延長技術和冷凍休眠技術上，突飛勐進。這意味著現存的滄瀾人可以存活更長的時間，卻沒有解決根本問題。沒有新生命的加入，他們的人口數量，還是隨著時間的推移不斷減少。
在滄瀾人的人口數量減少到五萬人的時候，他們停止了徒勞的研究工作，將更多的人送入了休眠狀態，只留下12個人，看護飛船，維護亞特蘭蒂斯古城。維持一個面積巨大，裝置眾多的大型城市的正常運轉，只靠他們12個人肯定是不夠的。為了解決人手不足的問題，留守的滄瀾人去附近的大陸上，找來了一批遠古人類，然後教導他們語言文字和各種知識，讓他們成為了合格的工人，承擔起維護亞特蘭蒂斯古城的工作。這些被滄瀾人收留的遠古人類，就是前文提到的神恩族人，也是古埃及人的祖先。可以說滄瀾人這無意中的一個小舉動，加速了人類文明的啟蒙，為之後人類語言文字的形成，科技知識的爆發式增長，奠定了基礎。
如此又過去了數千年，當滄瀾人的人口數量降低到了一萬人的時候，他們不得不收回了最後的留守人員，將亞特蘭蒂斯古城徹底交給神恩族人打理，而後全員進入到了休眠狀態，等待奇蹟的發生。此後的故事，李翔在海底遺蹟發掘出的書籍中都看到過了，神恩族人以亞特蘭蒂斯古城為根基，開枝散葉，建立起強大的王國，巔峰時期曾將大半個歐洲納入版圖。而後天降橫禍，一場烈度極高的地震，發生在亞特蘭蒂斯海島附近，整個亞特蘭蒂斯古城，連同其中的數百萬神恩族人一起葬身大海。滄瀾人和他們的家園號移民飛船也一起埋葬在了海底，不過家園號畢竟是滄瀾人舉全族之力，打造出來的終極科技結晶，地震、海嘯都沒給它造成太大的損壞，休眠中的滄瀾人也在家園號的庇護下也得以倖免於難。
後來有部分滄瀾人從休眠中醒來，發現了家園號目前身處海底，且狀態不佳。他們喚醒了更多的滄瀾人，對家園號飛船進行了全面的修復。此時這些滄瀾人是有能力將家園號重新啟動，離開海底，另選一個妥善的位置安置的。但他們商議過後，還是放棄了這個想法，回到休眠倉，繼續陷入了永無止境的沉睡。滄瀾人之所以做出如此消極的選擇，也是形勢所迫。冷凍休眠技術改進的再厲害，也不能阻擋時間的偉力的侵蝕。在休眠狀態下，滄瀾人的生命流逝速度只是減緩了數十倍而已，時間一長，他們還是會變老，會死去。而此時滄瀾人剩餘的人口已經不足五千，且所有人都已經十分的蒼老，時日無多，他們已經沒有足夠的時間，去重新建立一座城市，培養一批人類做手下了。一動不如一靜，與其回到陸地上，去面對未知的風險，還不如待在海底，靜待時間的流逝，最終時刻的到來。
日升日落，寒來暑往，又是上萬年時光快速流逝，餘下的滄瀾人，或者在休眠中老死，或者主動放棄了休眠，選擇在清醒的狀態下，度過最後一段時光。隨著滄瀾人數量的急劇減少，家園號飛船內部也越來越冷清，越來越寧靜，最後只餘下一些機器人週而復始的做著打掃衛生和維護裝置的工作。直到兩艘科考船來到亞特蘭斯蒂遺蹟上方的海面上，李翔和耿懷遠乘坐深潛器進入飛船內部，這才打破了家園號長久以來的寧靜。而此時，飛船內的滄瀾人已經消耗殆盡，只剩下最後一名活著的倖存者，被飛船的預警機制喚醒，趕來接待兩個不速之客。
以投影方式出現在李翔二人面前的這名滄瀾人名叫亞古，曾是家園號飛船中最