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“Zion（錫安）”一詞在《聖經》中，是所羅門王建造聖殿所坐落的山，位於聖城耶路撒冷。而在猶太教中，“錫安”代表著上帝的榮耀，是神的救贖來臨的標誌。當大地被毀滅後，人類將在錫安接受最後的審判。新錫安與原來的那個被南炎洲隊毀滅了的錫安完全不同，不僅防禦更加強大，並且擁有著很多新式的武器，最重要的是，這裡有數座穩定的核聚變反應堆，可以這樣說，如果機械大軍想靠上次那種方法毀滅現在的這個錫安，根本就不可能。當然，如果他們用超大噸量核彈的話，那就沒話說了。
不過這個世界可是《機械公敵》，《終結者》的後續劇情世界，本來就已經經歷過一次全球性大規模核爆的地球，生態系統已經脆弱到了極點，在這個世界哪怕再來一次小規模的核爆，也是毀滅性的。繼承了《機械公敵》中·微琪·意志的電腦主宰，本來蓄養人類就是為了保護人類，只是方法極端了一點。現在要是用核武完全破壞地球的生態系統，甚至是破壞地球結構的穩定，電腦主宰，做不到。
那麼錫安的安全得到了保障，剩下的就是病毒問題了。御手洗已經在虛擬世界中游蕩了10天，連病毒的影子都沒有見到，他也找過先知，因為之前已經見過面（在《終結者》中），所以他也沒有客氣，直接問出了問題，而先知給他的答案和原劇情中一樣讓他吐血，
“我是先知，所以你相信我，但現在我卻更加相信你。”
御手洗終於脫離了虛擬世界，回到了錫安，因為龍崎不在，他只能找到暫時代替他的蒼井。
“你首先要明白，你並不是救世主，這個身份現在來說只是我們硬加在你身上的，儘管你擁有和救世主一樣，甚至更強大的力量。”蒼井到現在還沒有弄清楚為什麼要讓御手洗當救世主，不過她也知道自己不及龍崎，所以也沒有反對。
“不是真的救世主？”這種問題明顯以御手洗的智商是弄不明白的，而蒼井明顯覺得和他說話與和一頭牛說話沒什麼分別。
“真不明白你究竟有沒有研究《駭客帝國》這套電影的，不過龍崎也只是交代我們不要主動告訴你，既然你問了，我就告訴你吧，首先，你要明白什麼是Matrix。”
“Matrix不就是指虛擬世界嗎？”御手洗的話幫蒼井氣得差點想用他實驗一下她最近研究的新招。
Matrix的本意是子宮、母體、孕育生命的地方，同時，在數學名詞中，矩陣用來表示統計資料等方面的各種有關聯的資料。這個定義很好地解釋了Matrix程式碼製造世界的數學邏輯基礎。在電影中，Matrix不僅是一個虛擬程式，也是一個實際存在的地方。在這裡，人類的身體被放在一個盛滿營養液的器皿中，身上插滿了各種插頭以接受電腦系統的感官刺激訊號。人類就依靠這些訊號，生活在一個完全虛擬的電腦幻景中。機器用這樣的方式佔領了人類的思維空間，用人類的身體作為電池以維持自己的執行。
在這裡，Matrix是一套複雜的模擬系統程式，它是由具有人工智慧的機器建立的，模擬了人類以前的世界，用以控制人類。在Matrix中出現的人物，都可以看做是具有人類意識特徵的程式。這些程式根據所附著的載體不同有三類：一類是附著在生物載體上的，就是在矩陣中生活的普通人；一類是附著在電腦晶片上的，就是具有人工智慧的機器；這些載體透過硬體與Matrix連線。而另一類則是自由程式，它沒有載體，諸如再特工、先知、建築師、梅羅文加、火車人等。
Matrix是一個巨大的網路，連線著無數人的意識，系統分