然而，沉思邊界——可以說是個虛空之界，但又並非如此。
沉思邊界由方圓組成，外圓內方，直徑六十米。它與外界有一層一米厚的牆，可以從裡面看到外面，但不能從外面看到裡面，可以從裡面聽到外面的任何聲音，但外面卻聽不到裡面的任何聲音。總之，外面的一舉一動，都能在裡面瞭如指掌，透過視像監測看得一清二楚。
沉思邊界的上空是固定的形狀，如天穹一樣。外面一進入到裡面會見到一個四方空間，擁有四面牆壁。從門中進來的這面牆壁可以用來播放高畫質晰光電立體資訊，如光影視像，而其他三面牆壁也能顯示出影像，除此之外還可以通透得讓氣體分子向裡或向外自由地流動，不過直徑較大的一些分子氣體則不行。
而且這些牆壁在系統調控下可以變化多端，層層相鋪，可以相互轉換疊加，消失或生成任何形狀的隔離牆壁。從上空往下看，它們可以變為方形，或圓環形，或如一點向四面裂開的多角隔離空間，只要根據自己的喜好隨時都能變化。
然而這種虛空型牆壁是由無數的虛擬光影粒子結合而成的，一般在沒有解開控制的情況下，人體不可以直接從牆壁這一頭穿越到那一頭，雖然撞上去不會疼痛，但人體和牆壁接觸的那一剎那，人體會被靜止下來，不能前進，如被牆壁放射出來的肉眼看不到的粒子索線捆綁住一樣，動彈不得。空間的大多數景觀都是透過這種虛擬光影粒子變化而來。
沉思邊界與外界隔絕開來後，能阻擋外部的一切訊號，外界的空氣需要透過九十九道淨化程式，變為純淨無雜的空氣才能進入裡面。除了長生、祖慧和宇主三人之外，外部的人無人知曉這個空間——可以看出三人的關係親近無隙。
在宇國，長生知道的隱蔽空間只有四個，沉思邊界是其中之一，屬於長生在使用。宇主把沉思邊界交付給他時還對他說這是為他建造的宇國唯一的隱蔽空間，可以用來避難、學習或鍛鍊技能，只有他一人能從裡面進出。不過，至今為止，雖說只有長生才能透過自身的基因密碼自由地進出此地，但宇主和祖慧也可以用自己的密碼進入兩人空間，因為宇主早就掌握了兩個孩子體內的基因密碼，祖慧早就與他親密無間。
不過，當時長生還不知道宇國有另外三個隱蔽空間，到後來，才逐漸知道宇主也給祖慧建造了一個隱蔽的空間：學思邊界——這個空間在宇國的另一端，和沉思邊界的相向相反。除此之外，宇主還建造了二個更為隱蔽的空間，一個是國宇中心，它在宇國廣場下方的正中心位置，長生去過兩次；還有一個就是圓夢中心，與長生的沉思邊界靠得比較近。但圓夢中心除了宇主知道之外，長生和祖慧都不知道宇國存在這個極度隱蔽的空間。可見，圓夢中心在宇國是屬於第一隱蔽的空間了。
當宇主對長生說沉思邊界還有祖慧也可以進去時，他早已看好了徒弟長生的前程，以及長生的基因——宇國生化人中最為優良的基因。他是宇國的最佳基因原材料人選。當然他希望自己的女兒與最優秀的徒弟有一天能夠結成一對眷侶，以此遺傳下更為優良的基因，自然而然地生下更加優良的後代，這樣的配對才極其完美。
宇主在2606年親自把沉思邊界打造出來。隨著長生長大，一直與祖慧在一起，宇主想長生從研究發明室出來之後已經透過了一切考核，總不能讓他住集體房間吧，需要為他安排私人空間才能適合他的成長。
不過，長生每當煩惱或需要完成高強度技能學習達到最後衝刺的時候，他總會來到沉思邊界，如古代的人所說的閉關修煉。長生漸漸明白，這是一種獨立精神的心靈被開啟時的狀態，心靈世界被開啟後，強大力量都會往心靈的裡面或外面流動。這時候，學習便會暢通無阻，無往不利，心靈中的境界也會因此提高數倍。
可是