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從空中看下去，潛艇船塢與其他的船塢實際上沒有太大的區別。當時，珍珠港裡有三座專用的潛艇船塢，這些船塢為執行破交作戰的美軍潛艇提供正常的維護與保養工作。除了夏威夷島上的希洛有專門的潛艇碼頭之外，珍珠港裡的這三座潛艇船塢是當時美軍在夏威夷群島裡最重要的潛艇保障設施了。而相對與普通的船塢而言，潛艇船塢更為堅固，更加難以摧毀。當初，英國空軍為了摧毀德國設在不萊梅港個潛艇船塢，還專門製造了重達2噸的超級炸彈，結果收效都不太明顯。就算美軍的潛艇船塢的堅固程度與經常遭到轟炸的德國海軍的潛艇船塢無法相提並論，可是要想用500公斤的航空穿甲彈擊穿船塢頂部數米厚的鋼筋混凝土，並且炸燬其內部設施，這也是一件勉為其難的事情。
當炸彈爆炸時產生的硝煙騰到半空中的時候，秋耿波這才後悔了。作位經驗豐富的飛行員，秋耿波能夠從爆炸後產生的硝煙的形狀，濃度，以及火光的大小判斷出炸彈有沒有擊中目標，或者是有沒有摧毀目標。顯然，這次他太失望了，500公斤的航空穿甲彈能夠擊穿一米厚的鋼筋混凝土就已經算是運氣了，顯然，這枚炸彈除了在潛艇船塢的頂部留下一個大彈坑，震壞一些內部設施，也許還能震傷幾名美軍之外，就沒有其他的效果了。
“孃的，我們這下算是碰到鐵烏龜了！”
“上校，楊士洪他們快到了，我們現在返回艦隊還來得及再飛一趟！”
秋耿波有點不服氣的看了一眼那座在煙塵籠罩下的潛艇船塢，然後很不甘心的返航了。實際上，除了他自己的轟炸沒有取得多大的效果之外，機群裡的其他轟炸機基本上都找準了自己的目標，而且將炸彈的威力發揮了出來。
在第二特混艦隊的轟炸機群到達之前，秋耿波機群已經炸沉了港口內的十幾艘大大小小的艦船。其中有兩艘萬噸輪是在準備離開港口的時候被炸沉的，這兩艘輪船都在港口的出口處擱淺，堵死了通道，導致後面的艦船根本就無法出港疏散。另外，有兩座幹船塢被徹底摧毀，這兩座船塢都各捱了數枚炸彈。還有一座船臺被炸成了廢墟，幾座倉庫，兵營也捱了炸彈。
楊士洪率領的第二特混艦隊的第二批轟炸機群只晚了十五分鐘到達，結果留給他們的目標就少了近一半。楊士洪他們沒有手軟，魚雷轟炸機全都集中對付艦船，兩艘已經衝入淺灘區擱淺的萬噸輪被擊中，發生了猛烈爆炸。俯衝轟炸機則繼續對付港口裡的重要基礎設施，其中有一隊俯衝轟炸機還去轟炸了福特島上的美國海軍航空站。而在郝東覺看來，最重要的還是對美軍戰區司令部的轟炸。只是，郝東覺並不清楚，尼米茲的司令部早就已經轉移了，美軍太平洋戰區司令部不過就是一座沒有幾個人看管的大樓而已，投在那裡的十幾枚炸彈其到的效果是相當有限的。
第四特混艦隊的轟炸機群最後到達，黃曉天安排了好幾名領隊指揮轟炸。此時，珍珠港裡已經是硝煙瀰漫，值得轟炸的重要目標被摧毀了絕大部分。因此，第四特混艦隊的轟炸機群是來擴大戰果的。其中最重要的船塢，船臺，海軍修船中心，倉庫，兵營都遭到了反覆轟炸。那些擱淺了，但沒有沉沒的戰艦也再次捱了炸彈或者是魚雷。在最後一架轟炸機離開珍珠港上空的時候已經是七點四十分過了。整個第二輪轟炸只用了大概四十分鐘的時間。
各機群的轟炸報告是陸續發回來的，談仁皓一直在焦慮的等待著返航機群的報告，因為按照計劃，如果第二輪轟炸沒有能夠徹底摧毀珍珠港的話，那麼還得安排補充轟炸，甚至是第四輪補充轟炸。楊勤凱的機群在六點過的時候就返回了艦隊，天亮後，這些轟炸機都已經補充了燃料，只是沒有急著掛上炸彈，航空勤務人員正在抓緊一切時間來檢查每一架轟炸機的狀態。
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