就政治理念而言，他本人也反感內廷，但深知改革的步伐不能邁得太大，否則必然會絆跟頭，而且曹操也斷然不肯同意。要是因為這件事而根本上忤逆了曹操的意思，進而使得曹操對整套新的官僚體系都表露出不信任感，恐怕會撿不著芝麻，更丟了西瓜呀。
內廷說白了，乃是人主用以擴充套件權柄、制約外朝的主要工具，你可以想辦法裁抑之，但不大可能一朝一夕便徹底消滅之。曹操作為一名強勢君主，又是幕府那種草臺班子玩兒慣了的，不讓他跟自家親信、侍從之臣見天兒開小會是不可能的。所以最後的設計，是分內廷為三省，裁減並且拆分其權，而且內廷侍從之臣的品秩也要遠遠低於外朝。
先形成這種制度，那麼等到換了一個並不那麼強勢的君主上臺以後，就可以逐漸把內廷的影響力給限制到最小範圍啦。
只有一點是勳與陳群等人全都堅持，即內廷皆用士人，而絕不命以閹宦。這點倒是容易透過，因為曹操雖然是閹宦家庭出身，但他起家之途就是靠著跟宦官集團劃清界限，才能為士大夫們所引為同類的，而且東漢常侍之禍，但凡四十歲以上計程車人還都記憶猶新，目為殷鑑。所以設定了這麼一套制度，起碼可以保證曹魏三代之內，不大再會出現宦官干涉政務之事。
果然他們的設計上報曹操，曹操原則上贊同，實際上做了點兒微調，又略略擴充了內廷的權力。就此秘書監楊修和門下監劉放二人，權勢便即凌駕各部之上，而僅在三臺長官之下。
是勳有時候也會暗中慨嘆：“孫彥龍，吾誤卿也。要是按照原本的歷史軌跡，你應當跟劉放二人官位相侔才是……”
再一便是刺奸和校事，原本在是勳的計劃中，是將這一特務機構完全從君主身邊剝離開來，而歸之於掌握監察大權的御史臺。然而曹操大筆一揮，把他們給分去門下監了——這機構我用著順手，不打算放棄。
自荀攸以下，包括陳群、劉曄、毛玠等群臣紛紛往諫，荀、陳等人還算婉轉其辭。毛玠那話就說得很難聽了：“君不信臣。何以使臣效死命乎？”可是終究曹操有自己的主意。也有自己的底線，把所有的諫言全都當作耳旁風。
於是群臣只好把當年扳倒過趙達的大“功臣”是勳給推出去了，是勳無奈之下，一步一頓地來找魏王曹操。曹操知道他的來意，便道：“孤意定矣，即宏輔之舌，恐亦無以搖也。”是勳點點頭，說正因為如此。所以我才猶豫，不知道該怎麼開口才是……可是大家夥兒公推啊，我又不能不硬著頭皮來跟您隨便說叨幾句。
曹操聞言，不禁笑了起來，說好，那你就開口吧，孤洗耳恭聽。是勳斟酌一下詞句，首先就問啦：“大王乃知何以群臣皆惡校事耶？”曹操冷笑道：“乃為彼等有私，不欲孤知耳——似宏輔無私，則不勸孤去校事也。”
是勳說您太高抬我了：“人非聖賢。孰能無私，孰能無過？若恐其私其過為大王所知。何以不奏免御史耶？”同樣是監督官民的機構，為什麼大家夥兒就光反對校事，而不反對御史臺呢？“為御史所發，皆有所本，而校事所發無本，只逢人主之慾耳……”御史臺搞調查，有明確的法律規條為準繩，但校事搞調查，卻是隨心所欲，只琢磨君主喜歡聽什麼言語，想要打聽什麼事兒而已。
“御史之制，始於前漢惠帝，頒《監御史九條》，即詞訟、盜賊、鑄偽錢、獄不直、徭役不平、吏不廉、吏苛刻、逾侈、弩力十石以上。御史循此而察，吏民亦有所本。荀子有云：‘不教而誅，則刑繁而邪不勝。’今校事監察無所本，百官因此悚懼，為無所教而恐受其誅也……”
曹操說那好辦，我也給校事限定調查範圍就是了嘛——話說前漢那《監御史九條》，涵蓋面非常之廣，文辭又很模糊，我照樣出臺這麼一道法令，那跟沒有法令又有多大區別？