聯盟在歷經與“暗影追獵者”兩場驚心動魄的對決，成功扞衛自身安危、穩固探索根基後，科研團隊並未沉浸於勝利的餘韻，而是馬不停蹄地對戰場回收的資料、殘骸，尤其是從“死寂冰星”繳獲的敵方時空粒子炮改良部件及研究手稿深入剖析。在實驗室幽藍冷光下，伊文緊盯著全息投影中解析出的複雜圖紙，眼中光芒閃爍，似是在殘碎線索裡捕捉到了通往全新宇宙奧秘的線頭。“這些資料裡，隱藏著關於時空更深層架構的暗示，或許在宇宙遠古時期，曾存在過高度發達文明，深諳操控時空之力，‘暗影追獵者’不過是拾人牙慧，我們得挖掘源頭。”伊文沉聲道，手指在投影上滑動，圈出關鍵符文與能量線路圖。
基於此，科研團隊聯合考古學家、歷史學家組成跨學科調查組，依據古老星際傳說與模糊座標線索，鎖定一片位於銀河系邊緣、被稱作“星淵禁區”的古老星域。傳說那裡曾是上古文明繁華樞紐，因一場時空災難淪為廢墟，如今只剩殘垣斷壁在時空亂流中時隱時現，卻可能藏有解鎖終極時空科技的秘藏。聯盟高層決議派遣一支集科研、軍事、探險專長的綜合艦隊前往，既為追尋科技突破，也期望揭開那段被塵封歷史的面紗，艦隊由經驗豐富的指揮官亞歷克斯掛帥，旗艦“星耀探索號”搭載最新型時空探測裝置與改良防禦武器，躊躇滿志啟航。
艦隊踏入“星淵禁區”，周遭景象如夢魘扭曲。時空如破碎琉璃，忽而摺疊讓星辰似近在咫尺，忽而拉伸使光芒縹緲難追，常規導航系統陷入混亂，超維躍遷引擎也只能小心翼翼維持低功率執行，以防跌入未知時空裂縫。亞歷克斯站在指揮艙，緊攥扶手，目光透過舷窗凝視詭異虛空，下令：“開啟量子定位浮標，釋放探測無人機群，步步為營推進，留意能量波動異常。”無人機如銀色蜂群散開，穿梭迷霧，反饋回的資料在螢幕上拼湊出一副凌亂畫面：廢墟星艦殘骸龐大如山脈，鑲嵌著閃爍奇異晶簇，似是曾驅動它們穿越時空的能源核心；破碎空間站環繞荒蕪星球，金屬框架扭曲成匪夷所思形狀，仿若被巨力揉捻，隱隱散發古樸能量氣息。
在一顆死寂星球“克洛諾斯之骸”登陸時，探險小隊遭遇首波危機。星球表面沙礫在時空亂流吹拂下，竟似有了生命，聚整合沙暴巨人，揮舞沙礫手臂攻擊隊員。隊員們身著“星淵防護甲”，啟動護盾抵禦，手中鐳射槍射擊，可沙暴巨人不斷重組，難以傷其根本。隨行科研員艾麗西亞靈機一動，從揹包拿出“引力穩定器”原型機，調節引數，釋放區域性穩定力場，沙暴巨人受時空規則束縛，瞬間瓦解散落。眾人繼續深入，在一處遠古遺蹟山洞內，發現牆壁刻滿神秘符文，似在講述上古文明駕馭時空、穿梭星門開啟多元宇宙之旅，還繪有類似時空粒子炮雛形，與如今技術竟有微妙呼應，艾麗西亞興奮記錄、掃描，期望解讀出失傳操控秘訣。
艦隊航行至星域核心，一座恢宏“時空廢墟城”懸浮於時空漩渦中心，城垣由散發微光合金砌成，雖多有破損卻難掩昔日輝煌。可剛靠近，危險驟至。廢墟城釋放強力“時空封禁場”，如黏稠膠體困住艦隊，星艦引擎掙扎轟鳴，護盾滋滋作響，似要被撕裂。亞歷克斯果斷下令：“集中火力攻擊封禁場薄弱點，科研組解析破解頻率！”各艦鐳射炮齊射，能量光束在封禁場上綻出絢爛光斑，科研組緊盯儀器，伊文滿頭大汗推導公式，輸入破解指令，幾經波折，封禁場如玻璃破碎，艦隊脫困，卻也引得廢墟城防禦系統全面啟用。
機械守衛從城垛、暗道湧出，形似人形卻周身金屬鱗片，能發射“時空裂解射線”，所到之處時空破碎成鋸齒狀碎片，切割星艦。艦隊擺開防禦陣型，“星耀探索號”啟用改良時空粒子炮反擊，粒子光束與裂解射線碰撞，激盪起狂暴能量漣漪，震得艦身搖晃。萊昂指揮護衛艦靈活穿插，利用超維躍遷引擎微躍遷，繞到守衛後