東宋的監獄整頓完畢後，以前東宋監獄裡的那些烏七八糟以及骯髒的事情再也沒有在發生過了，東宋所有的監獄給人的感覺完全是煥然一新。
這次整頓監獄，段智鳴把衛生這一點也納入了監獄的管理範圍當中，正好也聯想到了另外一件事情，就是如何應對傳染病。
段智鳴非常的清楚，不管在什麼時候，傳染病的醫治難度都非常的大，一旦發生，所造成的死亡都非常的高。
雖然傳染病的醫治難度非常的大，但在預防這一塊卻非常的簡單，效果也非常的好。首先，所有的傳染病的特點都是有病原體，傳染性和流行性，感染後常有免疫性。有些傳染病還有季節性或地方性。傳染病的分類尚未統一，可以按病原體分類，也可以按傳播途徑分類。但不管傳染病如何分類，傳染病的預防都是採取以切斷主要傳播環節為主導的綜合措施。傳染病的傳播和流行有3個環節，即傳染源（能排出病原體的人或動物）、傳播途徑（病原體傳染他人的途徑）及易感人群（對該種傳染病無免疫力者）。若能完全切斷其中的一個環節，即可防止該種傳染病的發生和流行。各種傳染病的薄弱環節各不相同。在預防中應充分利用。除主導環節外對其他環節也應採取措施，只有這樣才能更好地預防各種傳染病。
段智鳴在登基前，看過記錄了東宋從立國到現在的史書，這本史書就記載了東宋發生過幾次非常嚴重的傳染病。而發生這幾次傳染病都是同一種傳染病，鼠疫。
雖然段智鳴不懂得醫學，對於鼠疫瞭解的不是非常清楚，但對鼠疫中的基本卻瞭解的非常清楚，那就是鼠疫之所以叫鼠疫，其實是由老鼠這種動物傳播的傳染病。
所以，要想徹底防範鼠疫，關鍵是控制老鼠的數量。只要控制住老鼠的數量，就能防止鼠疫發生甚至是傳播。另外鼠疫多發生在6~9月，肺鼠疫多在10月以後流行，這與鼠類活動繁殖情況有關。因此在6~9月以及10月是防範鼠疫的重點時間。
正好再過一個月就是6月了，段智鳴知道自己必須要趕快提前做好預防，不然的話，一旦發生了鼠疫，後果不堪設想。
尤其是衛靈，她現在懷有身孕。而孕婦的抵抗力恰恰好是最弱的，一旦感染了鼠疫，不但會影響自己，還會影響其肚子裡面的孩子。
於是，段智鳴立馬下達了防範鼠疫的通告。在通告中，段智鳴規定，東宋每一戶百姓、每一級官府機構，就連皇宮……只要是有人的地方，除了要做好衛生工作外，還必須要養一到三隻貓。尤其是街上那些乞丐，段智鳴則重點關注。因為那些乞丐渾身髒兮兮的，根本就不注意衛生，很容易會成為鼠疫的傳染源之一。為了防止乞丐成為鼠疫的傳染源之一，段智鳴下令各地官府必須要好好安頓那些乞丐，幫助他們在城裡安身。不得因為害怕乞丐成為鼠疫傳染源，而把他們拒之城外，否則將受到嚴厲的懲罰。對於那些沒有人的地方，段智鳴自然也沒有放過。他主要是讓人把這些沒人的地方做為養貓的場所，以避免這些沒人的地方成為老鼠的大本營，從而成為鼠疫的傳染源。
另外，段智鳴還在通告中規定，為防範鼠疫的需要，任何人都不得傷害或者是殺害貓。貓要是受傷了，獸醫必須要無條件的免費對貓進行救治。如果有人不遵守這一規定，就將依法從嚴懲治。
段智鳴之所以要這麼做，是因為貓是老鼠的天敵。所以段智鳴打算要利用這一點，讓貓吃老鼠，以減少老鼠的數量，從而減少鼠疫的傳染源。
同時，段智鳴還從太醫院以及民間找來了大量醫治過鼠疫的大夫，讓他們對鼠疫進行研究，好在萬一發生鼠疫後，可以有辦法制住鼠疫。不僅如此，段智鳴還讓東宋各地官府機構找了好幾個沒人又空曠的地方，做為鼠疫感染者的隔離區，以避免鼠疫發生後會擴大。