程啟琨回到了闊別一年的青山縣人民醫院傳染科，上班後乾的第一件事是糾正了一次誤診。一箇中年婦女因腹痛、腹部脹大、乏力三個月就醫，門診上腹ct檢查發現肝臟縮小、密度增加、大量腹水，報告為“肝硬化腹水”，收住院治療。病房接診的醫生正是梁金超，他檢視了病人後感覺有點不對頭，但又說不上來問題在哪兒，不知道該怎麼處理，他趕緊請程啟琨看病人。程啟琨一見病人精神好，體型略胖，面色紅潤，面板鞏膜不黃，無肝掌及蜘蛛痣，下肢無浮腫，腹部膨隆，觸診發現腹腔裡有個可移動的巨大球狀佔位腫物，經詢問患者食慾好。程啟琨分析道：“肝硬化腹水病人的腹部大多為‘蛙狀腹’，應該不會這麼顯著膨隆，而且通常有食慾不振、肝病面容、肝掌、蜘蛛痣及下肢指凹性浮腫；這些該病人都沒有，我認為診斷最大可能是‘巨大卵巢囊腫’，觸診可以感覺的到，其體積已經佔滿整個腹腔，由於腹壓增大，導致肝臟縮小、密度增加，從ct影像看就是肝硬化腹水，所以我們不能 迷信ct，要理性判斷。”在程啟琨建議下請婦科主任會診，主任完全同意程啟琨的判斷，病人很快轉入婦科，經手術證實就是“巨大卵巢囊腫”。
自從程啟琨進修學習歸來，梁金超追隨的腳步比先前更緊了，幾乎天天不離程啟琨左右，儼然就是程啟琨的得力助手，程啟琨常常結合實際病例給他講解，把他帶成了傳染科的中堅力量。
在程啟琨主持下，經向醫務科申報獲得了大力支援，傳染科每週開展一次專題學術講座，程啟琨把在北京學到的知識講給同事們，使本院對肝硬化、肝性腦病、慢性乙型肝炎以及常見傳染病的診療水平大大提高，大家都基本掌握了“慢性乙型肝炎”抗病毒治療的新進展，還有“肝硬化合並上消化道出血”以及“肝性腦病”等危重症的救治也達到了國內先進水平。
很多事情往往都是這樣：幹活兒的人多時活兒不一定多，越是人少時反而偏偏活兒越多。目前傳染科醫生值班的常規情況是：平時每天都有一個下夜班的、一個上夜班的，最近又有一位休產假的，隔兩三天還有個休班的。一天，又有一位醫生被臨時抽調下鄉義診去了，門診本來有兩位醫生，恰巧那天有一位在上班路上出了車禍，被撞傷住院了，本來傳染科醫生就很不足，這無異於雪上加霜，那天傳染病區只有程啟琨一個人值班。下午三點左右，突然一下子6個集體急性食物中毒病人同時住院！上吐下瀉，脫水比較嚴重，需緊急救治！程啟琨立即指揮護士建立靜脈通道，根據患者脫水程度及性質輸注相應電解質液體擴容、糾正脫水酸中毒、抗感染。他和護士分別聯絡醫務科和護理部請求抽調內科醫生及護士支援，護理部很快派來了兩個護士，可是醫院各科醫生都嚴重不足，能獨立值班的醫生基本都是一個蘿蔔一個坑，都很忙，過了好一陣子才來了一位新畢業的消化內科醫生，笨手笨腳的，在程啟琨的指導下，幹了一點工作，到了下班點就走了。值夜班的醫生偏偏因為有事耽擱了不能按時來接班，程啟琨必須堅守崗位，他和兩名護士連續作戰，一會兒給這個病人用這個藥，一會兒給那個病人用那個藥，看看這些病人的病情穩定下來了，脫離了危險。那時雖然值夜班醫生已經到位，但程啟琨也不打算下班了，因為工作沒有做完，還要抓緊寫好六份病歷，一直忙到凌晨二點多。護士煮好了泡麵給程啟琨送過來，發現他趴在辦公桌上睡著了，他太累了！護士不忍心驚醒他。凌晨四點多程啟琨因劇烈的上腹部絞痛醒來，他趕緊往衛生間跑，嘔吐大約200毫升咖啡色液體，護士趕緊打電話請來了消化內科醫生，醫生說程啟琨可能是因為疲勞過度、飢餓、睡眠受涼引發了“急性胃炎、胃出血”，囑護士給程啟琨輸液，打了止吐針，並告訴程啟琨暫禁食水，快晌午時做胃鏡檢查發現有“急性胃粘膜糜爛及散在出血點”，住