帶的濟遠艦以火炮被毀、船體損壞無法歸隊為由先於艦隊直接返回旅順。八月二十三日，丁汝昌、劉步蟾致電李鴻章稱：〃濟遠首先退避，將隊伍牽亂……〃對方伯謙要〃嚴行拿辦〃。八月二十四日，方伯謙被拘，二十五日天未明時，即被處死。丁汝昌從電請拿辦方伯謙到對其正法，只有短短三天，中間且未經任何審訊。有人認為，李鴻章、丁汝昌以雷霆手段處死方伯謙，其實質在於把方當做替罪羊，為李鴻章、丁汝昌的戰敗責任開脫。因為黃海戰敗，北洋海軍的最高指揮者李鴻章難辭其咎，艦隊提督丁汝昌也罪責難逃。為了脫罪，他們千方百計找替罪羊，炮製出方伯謙的三條罪狀，將戰敗責任全推在方的頭上。
當年留英學習海軍的薩鎮冰， 1880 年回國，1881 年，分撥到南洋水師，中國水師的部分戰艦任澄慶炮船大副。1882 年調任天津水師學堂教習。1886 年任威遠號（後改為康濟號）兵船管帶，1888 年晉升參將。1889 年，以參將銜補用都司，升署精練左營遊擊。1894 年5 月，晉升副將。
1894 年7 月25 日，日本海軍在朝鮮豐島海面對北洋艦隊實行突然襲擊。為加強威海衛港的防衛，丁汝昌調薩鎮冰率康濟號30 名水手守衛南口日島炮臺。1895 年1 月30 日，日軍開始進攻威海。薩鎮冰指揮南口日島炮臺守兵，奮勇抵禦來犯日軍的攻擊。日島乃一座約14 畝方圓的礁石島，於1878 年在此修建炮臺，置20 厘米口徑地井炮兩門，其他炮6 門。在日軍猛烈炮火打擊下，薩鎮冰帶領島上官兵誓死拼搏，頑強作戰，薩鎮冰率部下苦戰日島10 天，堅持不退，直至丁汝昌下令才撤回劉公島。
甲午一戰北洋水師覆滅後，薩鎮冰被革職，回福建老家，以教習西學為生。1896 年，薩鎮冰復出任吳淞炮臺總檯官。1905 年，升任總理南北洋水師，兼廣東水師提督，擔負起重組北洋水師、復興海軍的重任。1936 年冰心寫過一篇《記薩鎮冰先生》，說常常聽見她父親說：〃中國海軍的模範軍人，薩鎮冰一人而已。〃
甲午戰爭中國最終戰敗，簽訂《馬關條約》，割地賠款，賠銀2 億兩，約合3億日元，相當於清國政府三年的財政歲入。賠償金成為戰後日本擴充軍備、進行產業革命的本錢。這次戰爭是中日國運的轉折點，日本由此迅速崛起於東亞，躋身於世界軍事強國之列，而中國則一敗塗地，國幾不國，淪為了殖民地半殖民地。
嚴復與李鴻章關係微妙
1879 年，27 歲的嚴復，由於福州船政學堂缺乏教師，奉調提前回國任教。基於對他才幹的認可，1879 年10 月18 日，李鴻章致函李鳳苞，稱劉步蟾、林泰曾能調管大船，嚴復充學堂教習最為相宜，魏瀚、陳兆翱可勝督造快船。次年4 月28 日，李鴻章致函福州船政局督辦黎兆棠，調嚴復赴天津充天津水師學堂教習；8 月12 日，嚴復至天津，任命為天津水師學堂總教習。據後來薛福成考察，是因為〃嚴宗光於管駕官應知學問以外，更能探本溯源，以為傳授生徒之資，足勝水師學堂教習之任〃。因此他逃過了甲午黃海之戰這一場浩劫。於中法戰爭訂立和約一事中，他在與李鴻章關係上曾蒙上過一層陰影。
1883 年中法戰爭中，中國軍隊獲勝。李鴻章認為，此時與法國簽訂協約最為有利。清廷接受了李的建議，下令停戰。由擔任廣東稅務司的德國人德璀琳撮合雙方訂約，德璀琳從中欺騙了李鴻章，雙方簽訂了不平等條約。訊息傳出，朝野上下要求懲辦主張議和的李鴻章。事後，李懷疑嚴復也參與其中，對他產生了猜忌。他得到這個訊息之後，憤而自疏。他的弟弟去信勸他，對李鴻章的門路，還是要多走動走動為好。他聽從了弟弟的勸告，果然立竿