5月29日，富蘭克林受大陸會議指派，主持一個委員會以建立一個郵政系統。7月25日，他提交了工作報告。第二天，他當選為郵政總長，而年薪一千美元全部被他用於救助傷兵了。富蘭克林按照他的計劃建立起來的郵政系統，成為後來美國統一完整的郵政系統的基礎。
7月3日，富蘭克林當選賓州公安委員會主席，承擔起賓夕法尼亞繁重的練兵備戰工作。到9月底，他已經領導人們在河水中設定了17處障礙，建造了13艘戰船。這種戰船長50呎，兩舷各設槳手12名，士兵30—50人，船上配置有槍，使其在投入使用時猶如一座座移動的堡壘。
同時，富蘭克林仍然兼顧大陸會議的工作。7月13日，他受命為三名委員之一，負責處理居住在賓夕法尼亞和弗吉尼亞以西的中部印第安人事務；7月21日，會議決定考慮美洲國家的問題，富蘭克林宣讀了他的《聯邦和永久聯盟的檔案》，這是他將當年的“奧爾巴尼聯盟計劃”作了修改以適應變化了的情況後形成的。然而，除了傑斐遜和其他一些人以外，大陸會議從整體來說，尚未作好接受這樣的計劃的準備。富蘭克林也不強求。第二天，他奉派主持一個委員會考慮諾思的二月和解提案。31日，委員會提交的報告反對該項提案，會議表決否定了提案。
在幾乎整個8月，富蘭克林都忙於在賓州組建國民自衛隊、為戰船遴選軍官、為部隊獲取藥物，將火藥從費城軍火庫送往紐約的公安委員會等等。
9月18日，他被派往一個秘密委員會工作，進行槍用火藥的進口；22日，他又成為美洲貿易委員會委員；27日，他出席美洲哲學學會的年會。他擔任該會會長已達7年，而這一天是他第一次坐在會長的座椅上；30日，大陸會議選派他和兩位同事前往坎布里奇同華盛頓和新英格蘭當局會談關於支援軍隊作戰的問題。
兩個星期以後，富蘭克林一行來到了華盛頓的軍營。當時，英軍將領已被威廉·豪爵士取代，但英軍仍被封鎖在波士頓，只要他們一露頭，就會遭到賓夕法尼亞、馬里蘭和弗吉尼亞的國民自衛軍和林中狙擊手火力的致命打擊。大陸會議用來作為大陸軍的新英格蘭各聯隊，都是自願軍，即將解散回家。華盛頓要求召募一支兩千人、服役期至少一年、有著更好軍紀和更充足給養的新的軍隊。委員們和華盛頓及其幕僚開了4天會議，計劃重建軍隊，修改關於戰爭的檔案，制定交換戰俘和處理武裝帆船在海上奪取的戰利品的規則。那些武裝帆船中有一艘的船名是“富蘭克林號”，它們是美國海軍作戰的開始。那時，它們的任務是騷擾、襲擊英國的軍需船隻。這一次的共商軍務保證了獨立戰爭的繼續進行。
富蘭克林在返回費城的途中在羅德艾蘭稍事停留。5月份，他已得知，他的姐妹簡離開波士頓到沃裡克去了，猜想她一定和凱瑟琳·格林在一起。富蘭克林已向那裡給她寫了信。不久，他收到了回信，是簡和凱瑟琳一塊兒寫的，凱瑟琳自稱是“你終生的親切的朋友”。而現在，富蘭克林終於和他最喜歡的姐妹及最親愛的朋友在一起了。在這次愉快的相聚之後，富蘭克林帶著凱瑟琳10歲的兒子雷一道登程而去，雷將在費城入學。
短暫的輕鬆之後，是繁重忙碌的工作。
富蘭克林在啟程去坎布里奇之前當選了賓州議會議員，11月15日他回到費城時，議會正在開會；在大陸會議方面，11月16日他受命安排兩艘快船運送郵件；第二天，他被選入委員會處理殖民地俘獲的敵船和貨物；23日，被派入一委員會處置那些拒絕接受大陸幣的人；29日，他受命加入了一個秘密的5人委員會，任務是“和我們在大不列顛、愛爾蘭和世界其他各地的朋友們進行通訊聯絡”，即處理外務。此即美國國務部門的前身。
一年多以來，為數不