苻堅見慕容沖連戰連勝，也很擔心，遂派人給慕容沖送去一身錦袍，並在信中說：&ldo;想想當年我對你的恩情吧。&rdo;慕容沖讓人把錦袍送回，並答道：&ldo;我要的是天下，一件錦袍算什麼？&rdo;
苻堅知道大戰是不可避免的了，於是把目前的形勢向將士們講清，說明這是生死之戰，遂親自率領將士出城，身先士卒嚮慕容沖的軍隊殺去。這一仗慕容沖大敗，先敗退到仇班渠，又敗退到雀桑，再敗退到白渠。在白渠的時候慕容沖小勝一仗，但隨即又大敗，敗回阿房城。
慕容在長安得知慕容沖已打到城下，便派人聯絡城中所有的鮮卑人，準備裡應外合。結果左將軍竇沖有個小妾是鮮卑人，她知道哥哥要隨慕容沖發動兵變，便事先向竇沖告密，並請求饒恕她的哥哥。竇沖急忙報告苻堅。苻堅於是派人叫慕容入宮。慕容料到事情敗露，遂率眾殺掉苻堅派來的使者，準備奪城門衝出長安。當然苻堅早有防範，慕容被竇沖所擒。苻堅遂命將長安城中所有鮮卑，無論男女，全部殺死。
慕容沖聽說哥哥慕容被殺，痛哭失聲。不過，他很快就宣佈繼燕國皇帝位，並率全國所有的兵力二十餘萬，再次進攻長安。
這次長安之戰打了很長時間。慕容沖見強攻不下，便派兵把住通往長安的各處道口，斷了城中之糧，又縱兵在關中燒殺搶劫，百姓紛紛逃散。於是長安之外千里之內，人煙斷絕。長安城真正成了一座孤城。長安城外的一些將領也派兵來援，但因實力不濟，都被打敗。苻堅只好讓太子苻宏守城，自己帶著一千人馬拼命殺出重圍，向五將山（今陝西岐山縣東北）而去。
慕容沖只一心要攻下長安，而對殺苻堅不感興趣，並不派兵去追，而是加緊進攻長安。十日之後，長安城破，慕容沖帶燕兵入城後到處搶掠。苻宏帶著母親妻兒宗室男女，由八千士兵護著從南城突圍投奔東晉。
姚萇聽說長安城破，苻堅逃往五將山，不由大喜道：&ldo;這是天滅苻氏啊！&rdo;立刻派驍騎將軍吳忠即率五千騎兵飛速趕往五將山去擒苻堅。
苻堅知道吳忠來到五將山後，把自己計程車兵遣散，只有十多名侍衛堅持不走，勸苻堅突圍。苻堅道：&ldo;天命如此，走也無益。&rdo;最後被吳忠所擒。
因為苻堅當年擒獲姚萇後不但沒有殺他，而且還重用姚萇，一直對姚萇很不錯。姚萇不好意思與苻堅相見，讓吳忠把苻堅關在新平佛寺，又派人去向苻堅要傳國玉璽。苻堅瞪著眼睛罵使者：&ldo;小小羌奴也敢稱天子？玉璽已經在晉朝了！&rdo;
姚萇見得不到玉璽，又派尹緯勸說苻堅配合自己舉行個禪讓儀式，名正言順地把王位讓給自己。苻堅又罵道：&ldo;禪代是聖賢之間的事。姚萇是叛賊，沒資格！&rdo;罵完後又後悔地說道：&ldo;我很後悔當年沒有殺掉慕容垂和姚萇二賊，所以才有今天啊！&rdo;
尹緯的父親尹赤曾經是前秦的幷州刺史。前文說過，尹赤把大片土地和大隊軍馬交給敗逃到山西的姚襄，苻堅後來便不用尹赤的後人。尹緯到了四十歲的時候，才得以做了一名尚書令史，一直鬱鬱不得志，後來投到姚萇才得以重用。他聽到苻堅感嘆，不由想顯露一下自己的本事，於是道：&ldo;你認為你混到今日這個地步，是由於不殺二人之故麼？那你錯了。魏武帝在治世為能臣，在亂世為奸雄。假使你能夠把國家治理好，那此二人肯定是你的能臣。你想想你在王猛死後都做了些什麼？貪圖奢靡你承認不承認？假仁假義，有罪不罰；剛愎自用，好強爭勝，你有沒有？魏文侯曾經問李克：&l;為什麼吳國會亡？&r;李克回答說：&l;百戰百勝。&r;魏文侯奇怪道：&l;百戰百勝是好事啊，怎麼會亡國呢？&r;李克回答說：&l;仗