迫黎元洪集團委任之山西省長孫發緒離職。
閻錫山在此期間的熱衷表現不能不引起世人的關注。是故，當北洋*王士珍出面斡旋，調停紛爭時，特意致電閻氏，明告“昨奉明令，委張紹軒（張勳）以磋議調停之責，元首猶恐未周，復託錢君幹臣轉請徐東海合力匡救，將解決辦法明告錢君：（一）公府辦事人員，業經退出。修改憲法必可完全辦到。（二）解散國會即籌適當手續。（三）總統地位決不留戀。能及早調停就緒，即當潔身引去；萬一調停無效，即依法由副總統繼任，使南北不致紛爭，統一不致破裂。”“諸公志在匡時，心同愛國，謀慮之遠，豈讓士珍。特心所謂危，不敢不掬誠奉告，務希轉飭已動之隊，暫駐現至之地，未動之隊仍行駐紮原處。情急陳言，萬盼採納，並盼示覆。” 在上述情況下，閻錫山為與段祺瑞進一步聯絡，先後派參謀臺壽民、參事李慶芳赴京接洽。並於6月7日，再次致電段祺瑞，說明，“昨委託李參事慶芳呈上蕪函，計蒙覽，大局糾紛，國事方急，保持統一，全仗我公。前派參謀臺壽民馳赴總參謀處接洽一切，並飭晉謁鈞座，伏乞俯賜接納，時加訓誨，俾有遵循。” 明確表示願為“馳驅”。
在段祺瑞一手導演威逼下，黎元洪招架不迭，迫於情勢，遂於6月13日下解散國會之令，各省始相繼取消獨立。至於國務總理一席，各督仍意在擁段，作為過渡，以溫和派王士珍暫先組閣。有鑑於此，閻錫山於6月17日致電馮國璋，“請勸王士珍組閣”。電曰：“得悉西南各省已有動機，賴我公調停勸阻，不致戈操同室，老成匡國，言重邱山。尊電（指馮國璋6月16日致各省督軍“西南動態及取消獨立”之銑電）釜底抽薪，必先取消獨立，持平立論，敬佩莫名。竊以欲保共和，必當先謀統一，又必當先組內閣。今揆席尚懸，各省爭推王聘老出長斯席，即係為早日得人，維持統一起見。錫山曾電各省略謂：國會憲法未竟事宜，儘可公諸全國，從長計議。但俟閣揆定日，應即行恢復原狀。” 這一電文再次表明了閻對於“府院之爭”的基本立場。
一、獨特的政治統御 反對張勳復辟（1）
府院之爭的一個直接惡果是引發了“張勳復辟”的醜劇。對於“張勳復辟”，閻錫山則始終是持反對態度的。
張勳（1854－1923年），字紹軒，江西奉新人。曾先後在袁世凱帳下任管帶、副將、總兵。1902年，張到北京宿衛端門，多次充當慈禧太后和光緒皇帝的扈從；1910年，接統江防營；1911年8月，他被清廷任命為江南提督，堅決反對武昌起義，更反對各省獨立響應，認為“獨立即造反，反則皆賊也”；南京光復時，他負隅頑抗，後戰敗北逃；清廷退位後，張部被改編為武衛前軍，駐紮在山東兗州；張勳所部在民國時仍保留髮辮，故而被稱為“辮子軍”，張本人則被稱為“辮帥”；1914年，武衛前軍改稱定武軍，張勳本人被袁授予武衛上將軍；1916年，張又任安徽督軍。其部已擴充到57營20000餘人（張在辛亥革命後從南京撤退，其殘部最少時僅存1000多人）。張勳在1913年4月就陰謀擁溥儀復辟，因機密洩露而止。1916年袁世凱稱帝的時候，張勳又企圖勾結北方的另一鐵桿保皇黨升允共同擁溥儀復辟。袁世凱帝制失敗，張不僅賊心不死，反而荒唐地認為袁的失敗是他“辜負皇恩”出賣清王朝的結果。因此張的復辟之火由袁之死而更加狂熱起來。
府院之爭為張勳復辟提供了一個求之不得的機會。“長江巡閱使兼安徽督軍張勳，原與段祺瑞不謀，他屢次在徐州邀集各省代表開會，聲勢很可左右時局，黎元洪想籍他的勢力抵擋段祺瑞，於是便召他入京。” 就在府院之爭僵持之際，6月2日，黎元洪“明令”“張勳、徐世昌合力調停”。 6月7日，張勳率所部10